RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 OLFML2BQ68BL8 750 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PI16Q6UXB8 463 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF600Q6ZNG1 722 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MTMR9Q96QG7 549 aa4.95□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.95□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF521Q96K83 1311 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.95□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 DDX5P17844 614 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 DSTNP60981 165 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 PREBQ9HCU5 417 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ATPIF1Q9UII2 106 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM184BQ9ULE4 1060 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ECM29Q5VYK3 1845 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPY2A6NKD2 308 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 SEPT4O43236 478 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC6O75061 913 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TCEA3O75764 348 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPY3P0CV98 308 aa4.95□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 HSD3B2P26439 372 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPY1Q01534 308 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FAPQ12884 760 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.621e-9■■□□□ 12
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RABGGTB-213ENST00000496055 CFAP157Q5JU67 520 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PQ67 120 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TADA3O75528 432 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM27P14373 513 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 AKR1A1P14550 325 aa4.94□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 EVI2BP34910 448 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CETN2P41208 172 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PLTPP55058 493 aa4.94□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 TSC22D3Q99576 134 aa4.94□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 GJD2Q9UKL4 321 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV6A0A075B6T7 132 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TOR1BO14657 336 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FOSL2P15408 326 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 LMNB2Q03252 620 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 AAK1Q2M2I8 961 aa4.94□□□□□ -1.62
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