RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa11.75□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 KAT6AQ92794 2004 aa11.75□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 COL1A2P08123 1366 aa11.75□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 EVPLQ92817 2033 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 A6NJR5 290 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 MAGEB2O15479 319 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 AKAP3O75969 853 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CASP4P49662 377 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CCZ1BP86790 482 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 RBL2Q08999 1139 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 SYCP1Q15431 976 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 MFSD14CQ5VZR4 134 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 LHX8Q68G74 356 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM186BQ8IYM0 893 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 TC2NQ8N9U0 490 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 RETREG2Q8NC44 543 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CCDC112Q8NEF3 446 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 DEPTORQ8TB45 409 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CCDC51Q96ER9 411 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 BORCS6Q96GS4 357 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM161BQ96MY7 647 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa11.74□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 LRRIQ4A6NIV6 560 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 H3BRB1 525 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 MAPK13O15264 365 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 EXOC3O60645 756 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 GYPCP04921 128 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF286BP0CG31 522 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 SKILP12757 684 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 INSRRP14616 1297 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CYP2J2P51589 502 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 FIGNQ5HY92 759 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 TAS1R3Q7RTX0 852 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 TLK2Q86UE8 772 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CNGA4Q8IV77 575 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA1524Q8TCG1 905 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 PANX2Q96RD6 677 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 AP5M1Q9H0R1 490 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 TMX1Q9H3N1 280 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 SUGCTQ9HAC7 445 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.73□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 ANKRD63C9JTQ0 380 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 K7ERI5 159 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 ASAP2O43150 1006 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 MFAP3LO75121 409 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 C22orf31O95567 290 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 PIGRP01833 764 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 AFPP02771 609 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 AKR1A1P14550 325 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 GARTP22102 1010 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CNGA1P29973 690 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CASP14P31944 242 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CPT1AP50416 773 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 GOLGA8FQ08AF8 430 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 KCNH2Q12809 1159 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 STRN3Q13033 797 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CAPSQ13938 189 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 TFDP1Q14186 410 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 EFCAB12Q6NXP0 572 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.72□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1W2PQJ5 194 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 TISP43B9A030 160 aa11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
ECHDC3-204ENST00000495787 STX10O60499 249 aa11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms