RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495354.1

ARF4-208, Transcript of ADP ribosylation factor 4, human

TSL 3

Gene ARF4, Length 495 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARF4-208	ENST00000495354	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	ASAP2	O43150	1006 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	EDIL3	O43854	480 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	NR1I2	O75469	434 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	STBD1	O95210	358 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	ADH1A	P07327	375 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	WEE2	P0C1S8	567 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	AXL	P30530	894 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CLCN4	P51793	760 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	TDG	Q13569	410 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	HACE1	Q8IYU2	909 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	GJA10	Q969M2	543 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	TMEM150B	A6NC51	233 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354		M0R2N6	131 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	TBX3	O15119	743 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	MARCH6	O60337	910 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	SOD2	P04179	222 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	LETM2	Q2VYF4	491 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	C4orf19	Q8IY42	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	FLCN	Q8NFG4	579 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	PRR23A	A6NEV1	266 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	GLUD1	P00367	558 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	ITGA4	P13612	1032 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	AOC1	P19801	751 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	RFX1	P22670	979 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	TFDP1	Q14186	410 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	INF2	Q27J81	1249 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	KSR1	Q8IVT5	923 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	MTR	Q99707	1265 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	LXN	Q9BS40	222 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	NRP1	O14786	923 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	SLC37A4	O43826	429 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	C1R	P00736	705 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	GLUD2	P49448	558 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	AK2	P54819	239 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	CREM	Q03060	361 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	EMC2	Q15006	297 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	EPHA7	Q15375	998 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	NXPE3	Q969Y0	559 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	VAV3	Q9UKW4	847 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	MYO10	Q9HD67	2058 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	EML1	O00423	815 aa		13.56	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms