RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPTORQ8N122 1335 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A1W2PQJ5 194 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBED1O96006 694 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP2C9P11712 490 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC5A2P31639 672 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYTH1Q15438 398 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPDYCQ5MJ68 293 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 RFX8Q6ZV50 586 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF804AQ7Z570 1209 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NUP85Q9BW27 656 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLVAPQ9BX97 442 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTPRMP28827 1452 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYO5BQ9ULV0 1848 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FUOMA2VDF0 154 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM205CA6NFA0 338 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FOXP2O15409 715 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 EXOC3O60645 756 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TAC1P20366 129 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 AMPD1P23109 780 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLRC3Q07444 240 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 LPIN1Q14693 890 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NTRK3Q16288 839 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACAD11Q709F0 780 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 OXER1Q8TDS5 423 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SUCLG2Q96I99 432 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FNBP1Q96RU3 617 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 HGH1Q9BTY7 390 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CEP44Q9C0F1 390 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERCC6L2Q5T890 1561 aa7.37□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP31Q70CQ4 1352 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC160A6NGH7 325 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC53A6NM62 1247 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NBPF26B4DH59 902 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 STRNO43815 780 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FBXO21O94952 628 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TFAP2AP05549 437 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 VDRP11473 427 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRABP2P29373 138 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 COG7P83436 770 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDR2Q01850 454 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM29Q14134 588 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NAB2Q15742 525 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIX5Q8N196 739 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CEP72Q9P209 647 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 DKK3Q9UBP4 350 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NR2E1Q9Y466 385 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAST3O60307 1309 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRIT1O00522 736 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CBFA2T3O75081 653 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP1O94782 785 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 STT3AP46977 705 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPIDRQ14159 915 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NADK2Q4G0N4 442 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC174Q6PII3 467 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 UNC13DQ70J99 1090 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADSSL1Q8N142 457 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACTRT1Q8TDG2 376 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 WNK3Q9BYP7 1800 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 GSC2O15499 205 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBC1D12O60347 775 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MMP1P03956 469 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms