RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490308.1

EPB41-212, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1, humanhuman

TSL 3

Gene EPB41, Length 354 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41-212ENST00000490308 H7C0S8 307 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 LINC01387J3KSC0 135 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 STXBP3O00186 592 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 NPHS1O60500 1241 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 TSPAN3O60637 253 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 COBLO75128 1261 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 PPFIA3O75145 1194 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 INMTO95050 263 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 ALDH2P05091 517 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 MYBP10242 640 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 MYL4P12829 197 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 PLS3P13797 630 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 TSHRP16473 764 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.915e-13■□□□□ 9.2
EPB41-212ENST00000490308 ATP5DP30049 168 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 SLC7A1P30825 629 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 ARL3P36405 182 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 ITGA8P53708 1063 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 MANFP55145 182 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 RAB1AP62820 205 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 MXRA7P84157 204 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 MALLQ13021 153 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 CDC16Q13042 620 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 MBTPS1Q14703 1052 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 POSTNQ15063 836 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 PDCD1Q15116 288 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 DENND5AQ6IQ26 1287 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 CNKSR3Q6P9H4 555 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 USP17L6PQ6QN14 398 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 RAPH1Q70E73 1250 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 CCDC91Q7Z6B0 441 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 NBPF11Q86T75 865 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 RPAINQ86UA6 219 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 IQCA1Q86XH1 822 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 C2CD5Q86YS7 1000 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 TEX11Q8IYF3 940 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 CCDC105Q8IYK2 499 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 KIAA2013Q8IYS2 634 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 OXR1Q8N573 874 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 DTWD1Q8N5C7 304 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 ATG16L2Q8NAA4 619 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 DAGLBQ8NCG7 672 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 RCBTB1Q8NDN9 531 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 OR14C36Q8NHC7 312 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 DNAJB8Q8NHS0 232 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 CYP2W1Q8TAV3 490 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 FAM71BQ8TC56 605 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 THAP4Q8WY91 577 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 ANKS1AQ92625 1134 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 HTRA1Q92743 480 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 EID2BQ96D98 161 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 TBC1D31Q96DN5 1066 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 RADILQ96JH8 1075 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 FANCD2OSQ96PS1 177 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 ASB2Q96Q27 587 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 IWS1Q96ST2 819 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 NCAPGQ9BPX3 1015 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 C22orf23Q9BZE7 217 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 EDEM3Q9BZQ6 932 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 RNF208Q9H0X6 261 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 EPB41L1Q9H4G0 881 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 CNTD2Q9H8S5 307 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 SUGCTQ9HAC7 445 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 HAUS2Q9NVX0 235 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 CLDND1Q9NY35 253 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 MYO1AQ9UBC5 1043 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 HCN2Q9UL51 889 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 SLC39A10Q9ULF5 831 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 AP4E1Q9UPM8 1137 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 KNSTRNQ9Y448 316 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 NR2E3Q9Y5X4 410 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 ATP23Q9Y6H3 246 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 IKBKGQ9Y6K9 419 aa3.09□□□□□ -1.91
EPB41-212ENST00000490308 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
EPB41-212ENST00000490308 PI4KAP2A4QPH2 592 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms