RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482686.5

PRKCZ-218, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-218ENST00000482686 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.62■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 TLR9Q9NR96 1032 aa20.62■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 HES2Q9Y543 173 aa20.62■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 LTBRP36941 435 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 BCAR1P56945 870 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 UBE3AQ05086 875 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 KRT79Q5XKE5 535 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 NOTUMQ6P988 496 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 PNMA5Q96PV4 448 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 RSAD1Q9HA92 442 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 IPPQ9Y573 584 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 NCOR1O75376 2440 aa20.61■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 TRIP11Q15643 1979 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 FSCN2O14926 492 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 TBX10O75333 385 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 EYA4O95677 639 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 EDN1P05305 212 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 AXLP30530 894 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 PLCB3Q01970 1234 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 PGBD4Q96DM1 585 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 PLIN2Q99541 437 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 APOL6Q9BWW8 343 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 GBP3Q9H0R5 595 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 CSRNP2Q9H175 543 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 RNF39Q9H2S5 420 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 SPG21Q9NZD8 308 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 USP20Q9Y2K6 914 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 STK24Q9Y6E0 443 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 NPTXRO95502 500 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 IL9P15248 144 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 PPM1AP35813 382 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 NRIP1P48552 1158 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 GRIN1Q05586 938 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 CLUL1Q15846 466 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 BRAPQ7Z569 592 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 PER2O15055 1255 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 ITGA4P13612 1032 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 LIG1P18858 919 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 SYT1P21579 422 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 NAMPTP43490 491 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 RESTQ13127 1097 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 DAW1Q8N136 415 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 CCDC51Q96ER9 411 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 DNM3Q9UQ16 869 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 LZTS1Q9Y250 596 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-218ENST00000482686 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 DDHD2O94830 711 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 GLP2RO95838 553 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 POMCP01189 267 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 MLH1P40692 756 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 SLC11A1P49279 550 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 MAPK7Q13164 816 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 ADAM15Q13444 863 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 HYIQ5T013 277 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 DEPTORQ8TB45 409 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 URGCPQ8TCY9 931 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 LRRC15Q8TF66 581 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 GAD1Q99259 594 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 TCF25Q9BQ70 676 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 FZD8Q9H461 694 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-218ENST00000482686 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms