RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 FAM167AQ96KS9 214 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 IRAK3Q9Y616 596 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 LILRB3O75022 631 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 PSMD10O75832 226 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MYBP10242 640 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CLCN5P51795 746 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 RNF20Q5VTR2 975 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 GPR149Q86SP6 731 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 FLCNQ8NFG4 579 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 BRF1Q92994 677 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 SCLT1Q96NL6 688 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 RIT2Q99578 217 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 GBP3Q9H0R5 595 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CYP26B1Q9NR63 512 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CHST12Q9NRB3 414 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 DACT1Q9NYF0 836 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CFAP54Q96N23 3096 aa9.5□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 EVPLQ92817 2033 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 NARSO43776 548 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 GAS7O60861 476 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF623O75123 536 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MAFO75444 373 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CNPP09543 421 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 GNA11P29992 359 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 USP11P51784 963 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 PTPN14Q15678 1187 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MCTP2Q6DN12 878 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CABP7Q86V35 215 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 USTQ9Y2C2 406 aa9.49□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 EML1O00423 815 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TDP2O95551 362 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 ALDH2P05091 517 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 KLRC2P26717 231 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CLCN4P51793 760 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 RCAN1P53805 252 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 NPEPPSP55786 919 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TDGQ13569 410 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 XKR3Q5GH77 459 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 UBXN11Q5T124 520 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 POTEGQ6S5H5 508 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 GLB1LQ6UWU2 654 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 ANO5Q75V66 913 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 ADSSL1Q8N142 457 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TBCKQ8TEA7 893 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 KCNB2Q92953 911 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 KCNK12Q9HB15 430 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MIOSQ9NXC5 875 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 PLXNA3P51805 1871 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 DMDP11532 3685 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.48□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MYO10Q9HD67 2058 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.47□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms