RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 RSAD1Q9HA92 442 aa24.49■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 KANSL3Q9P2N6 904 aa24.49■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 C2orf71A6NGG8 1288 aa24.48■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 POTEMA6NI47 508 aa24.48■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 GALTP07902 379 aa24.48■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 ST3GAL1Q11201 340 aa24.48■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF174Q15697 407 aa24.48■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa24.48■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 AGMOQ6ZNB7 445 aa24.48■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 CASP10Q92851 521 aa24.48■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 IGSF21Q96ID5 467 aa24.48■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.48■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.48■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 ALDH2P05091 517 aa24.47■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 ITGA4P13612 1032 aa24.47■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 PTENP60484 403 aa24.47■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 MAEAQ7L5Y9 396 aa24.47■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 CNNM3Q8NE01 707 aa24.47■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 CPB2Q96IY4 423 aa24.47■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 DNAJB4Q9UDY4 337 aa24.47■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 POMCP01189 267 aa24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 AXLP30530 894 aa24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 RARRES1P49788 294 aa24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 UBXN11Q5T124 520 aa24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 NOTUMQ6P988 496 aa24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 ERMNQ8TAM6 284 aa24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 AUTS2Q8WXX7 1259 aa24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 UBN1Q9NPG3 1134 aa24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 FAN1Q9Y2M0 1017 aa24.46■■□□□ 1.51
RBMS1-211ENST00000477486 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 SLC11A1P49279 550 aa24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 KCNC3Q14003 757 aa24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 GIT2Q14161 759 aa24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 CES5AQ6NT32 575 aa24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 S1PR5Q9H228 398 aa24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 ARID2Q68CP9 1835 aa24.45■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 LOC730098B7Z3J9 87 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 TSPAN1O60635 241 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 ARL2P36404 184 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 PLA2G5P39877 138 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 POU5F1BQ06416 359 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 CAPSQ13938 189 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 SYCE2Q6PIF2 218 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 CATSPER3Q86XQ3 398 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 SUSD6Q92537 303 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 NACC1Q96RE7 527 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 APOL6Q9BWW8 343 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 ZBP1Q9H171 429 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 IPPQ9Y573 584 aa24.44■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 DDHD2O94830 711 aa24.43■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 OR52Z1P0C646 297 aa24.43■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 CTSAP10619 480 aa24.43■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 GLRA2P23416 452 aa24.43■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 HACE1Q8IYU2 909 aa24.43■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC51Q96ER9 411 aa24.43■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 CSRNP2Q9H175 543 aa24.43■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.42■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.42■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa24.42■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 SP100P23497 879 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 MBTD1Q05BQ5 628 aa24.42■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 TTC38Q5R3I4 469 aa24.42■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa24.42■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM175Q9BSA9 504 aa24.42■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.42■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 HES2Q9Y543 173 aa24.42■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 MED24O75448 989 aa24.41■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 OR1G1P47890 313 aa24.41■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.41■■□□□ 1.5
RBMS1-211ENST00000477486 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms