RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 LMNB1P20700 586 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 TNFAIP3P21580 790 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 MGAT5Q09328 741 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 PICALMQ13492 652 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 BLMHQ13867 455 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 MESDQ14696 234 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 CBWD6Q4V339 395 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 SAAL1Q96ER3 474 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 BTBD6Q96KE9 485 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 AKR1B1P15121 316 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 TAF11Q15544 211 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 PRR16Q569H4 304 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 PWWP2AQ96N64 755 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 CYP2J2P51589 502 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 PPP2R5EQ16537 467 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 CGB2Q6NT52 195 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 RDH13Q8NBN7 331 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM237Q96Q45 408 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR88Q9GZN0 384 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 A6NHS1 94 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 PDXKO00764 312 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 PYGMP11217 842 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 CHKAP35790 457 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 SNX1Q13596 522 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 ASRGL1Q7L266 308 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 KLHL33A6NCF5 533 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 COMTP21964 271 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 CHRNA3P32297 505 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 SNAP25P60880 206 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP11AP98196 1134 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 CROCCP2Q86T23 111 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 SH3GL3Q99963 347 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 TGFB1I1O43294 461 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 RARGP13631 454 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 VPS41P49754 854 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 NFIXQ14938 502 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 DNM3Q9UQ16 869 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 LINGO3P0C6S8 592 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 SMARCA1P28370 1054 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 PPP4CP60510 307 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 GSTO1P78417 241 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-206ENST00000469947 CYP4X1Q8N118 509 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms