RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 CLEC1BQ9P126 229 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 HCSTQ9UBK5 93 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 STK39Q9UEW8 545 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 KIF3AQ9Y496 699 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 A0A087WWV3 80 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 TBX10O75333 385 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 ERLIN2O94905 339 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 GALTP07902 379 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 OR52Z1P0C646 297 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 ITGA4P13612 1032 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 COL9A1P20849 921 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 MCM2P49736 904 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 ZP2Q05996 745 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 KCNC3Q14003 757 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 GIT2Q14161 759 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 CLUL1Q15846 466 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 TTC38Q5R3I4 469 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 UBXN11Q5T124 520 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 NOTUMQ6P988 496 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 SMRP1Q8NCR6 262 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 MCPH1Q8NEM0 835 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 LPPQ93052 612 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 IGSF21Q96ID5 467 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 CSRNP2Q9H175 543 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-210ENST00000463041 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 POTEMA6NI47 508 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 HIDE1A8MVS5 230 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 LAD1O00515 517 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 TSPAN1O60635 241 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 MED24O75448 989 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 GLP2RO95838 553 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 CYP11B2P19099 503 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 GLRA2P23416 452 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 PBX3P40426 434 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 CAPSQ13938 189 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 LONRF3Q496Y0 759 aa8.08□□□□□ -1.12
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PTPRF-210ENST00000463041 HACE1Q8IYU2 909 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 VPS52Q8N1B4 723 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
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PTPRF-210ENST00000463041 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM175Q9BSA9 504 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 RAB34Q9BZG1 259 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 RSAD1Q9HA92 442 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 LRWD1Q9UFC0 647 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 IRAK3Q9Y616 596 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 TRIP11Q15643 1979 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1B0GUA9 196 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 LOC730098B7Z3J9 87 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 INPPL1O15357 1258 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 DCXO43602 365 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 DDHD2O94830 711 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 CTSAP10619 480 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 SLC11A1P49279 550 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 MBTD1Q05BQ5 628 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 PTGDRQ13258 359 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 AMHR2Q16671 573 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 FAM187BQ17R55 369 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 PADI6Q6TGC4 694 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-210ENST00000463041 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.07□□□□□ -1.12
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