RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CSADQ9Y600 493 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GLTPD2A6NH11 291 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 F8VZ95 297 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.425e-7■■■■■ 31.5
PTPRC-210ENST00000462363 SLC16A4O15374 487 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KRT86O43790 486 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 DGAT1O75907 488 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ARIH2O95376 493 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A27O95847 323 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM49P0CI25 452 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM49CP0CI26 452 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TGFB3P10600 412 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SCP2P22307 547 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 RFX1P22670 979 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 COPB2P35606 906 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ARL2P36404 184 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 DLG4P78352 724 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PRKG1Q13976 671 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KIF22Q14807 665 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TCEAL1Q15170 157 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ASIC2Q16515 512 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GNPTABQ3T906 1256 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 XKR9Q5GH70 373 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GJB7Q6PEY0 223 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CREG2Q8IUH2 290 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 WNT2BQ93097 391 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TLR10Q9BXR5 811 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 STK33Q9BYT3 514 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PORCNQ9H237 461 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GCNT4Q9P109 453 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 NCANO14594 1321 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ABLIM1O14639 778 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 FAM189A1O60320 539 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 LRRN2O75325 713 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 OATP04181 439 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 EDN1P05305 212 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GARTP22102 1010 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GLRA2P23416 452 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KLRC1P26715 233 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEA1P43355 309 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CYP2J2P51589 502 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 VAMP7P51809 220 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PEX3P56589 373 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SOX10P56693 466 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CHMP4BP1P59074 171 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TUBB4BP68371 445 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MYL7Q01449 175 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KIF5AQ12840 1032 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 EMC2Q15006 297 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 Q3C1V9 767 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 METTL7BQ6UX53 244 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1328Q86T90 577 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CEP112Q8N8E3 955 aa6.15□□□□□ -1.42
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