RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 LRP8Q14114 963 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM14Q14142 442 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 PCOLCEQ15113 449 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 OCLNQ16625 522 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 RILPL1Q5EBL4 403 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 MANEALQ5VSG8 457 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 TTBK2Q6IQ55 1244 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 TXNDC11Q6PKC3 985 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 PCSK4Q6UW60 755 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 TREML4Q6UXN2 200 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 UNC5DQ6UXZ4 953 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 Q6ZVH6 145 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 NUTM1Q86Y26 1132 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 REXO1L1PQ8IX06 675 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 FAM20CQ8IXL6 584 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 LZTR1Q8N653 840 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 C7orf31Q8N865 590 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 PLA2G15Q8NCC3 412 aa-1.62□□□□□ -2.67
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SNORD54-201ENST00000459159 BLNKQ8WV28 456 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 SLC39A7Q92504 469 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF592Q92610 1267 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 BRF1Q92994 677 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 ZBTB9Q96C00 473 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 HPDLQ96IR7 371 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 C12orf49Q9H741 205 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 RMI1Q9H9A7 625 aa-1.62□□□□□ -2.67
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SNORD54-201ENST00000459159 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 LRFN1Q9P244 771 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 LIMD1Q9UGP4 676 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 ICAM5Q9UMF0 924 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 MMP24Q9Y5R2 645 aa-1.62□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 PLXNA2O75051 1894 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 TCP11X1B4DZS4 312 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 INAFM1C9JVW0 142 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 H0YJW9 148 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 LINC01387J3KSC0 135 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM22K7EJ46 135 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 CCL21O00585 134 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 DVL2O14641 736 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 CTAGE5O15320 804 aa-1.63□□□□□ -2.67
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SNORD54-201ENST00000459159 IRAK2O43187 625 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 HOXA2O43364 376 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 TBC1D12O60347 775 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 GRIN3BO60391 1043 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 PROP1O75360 226 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP-1.63□□□□□ -2.672e-32■□□□□ 10.3
SNORD54-201ENST00000459159 CD5P06127 495 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 PGRP06401 933 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 CD48P09326 243 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 SPATA31D3P0C874 917 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 FCGR2AP12318 317 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 DNAJB1P25685 340 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 MPGP29372 298 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 GJA4P35212 333 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 SOX9P48436 509 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 CDH15P55291 814 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 ANTXR2P58335 489 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 SH3BP2P78314 561 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 DPYDQ12882 1025 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 PDE3AQ14432 1141 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 DSC3Q14574 896 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM119Q4V9L6 283 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 AKNAD1Q5T1N1 836 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 SYDE2Q5VT97 1194 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF691Q5VV52 312 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 ACAD10Q6JQN1 1059 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 Q6ZSA8 131 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 OTOP1Q7RTM1 612 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 LNX2Q8N448 690 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 TPCN2Q8NHX9 752 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM40Q8WWA1 233 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 SHISA4Q96DD7 197 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 LRIG1Q96JA1 1093 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 MNTQ99583 582 aa-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
SNORD54-201ENST00000459159 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
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