RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EFHBQ8N7U6 833 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C2orf69Q8N8R5 385 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLRN3Q8NCR9 226 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LPIN2Q92539 896 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IPPKQ9H8X2 491 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OBP2AQ9NY56 170 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GIT1Q9Y2X7 761 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF609O15014 1411 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEP350Q5VT06 3117 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CFBP00751 764 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NOS3P29474 1203 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NFKBIBQ15653 356 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MINDY4Q4G0A6 757 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAVIN4Q5BKX8 364 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STRIP1Q5VSL9 837 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM20CQ8IXL6 584 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CPA6Q8N4T0 437 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WFDC12Q8WWY7 111 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DBNDD2Q9BQY9 259 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHST12Q9NRB3 414 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OXSMQ9NWU1 459 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSME4Q14997 1843 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VSTM5A8MXK1 200 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C9orf172C9J069 976 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HMMRO75330 724 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GSTM1P09488 218 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PF4V1P10720 104 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRK2P25098 689 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRK3P35626 688 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PURAQ00577 322 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MFSD14BQ5SR56 506 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CREB3L3Q68CJ9 461 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OTOP1Q7RTM1 612 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TPH2Q8IWU9 490 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SVOPQ8N4V2 548 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SVIPQ8NHG7 77 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAXDC2Q96IV6 333 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NACC1Q96RE7 527 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCN4AP35499 1836 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AOX1Q06278 1338 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRR33A8MZF0 331 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H7C1D1 291 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYO1BO43795 1136 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CREB3O43889 395 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOMM70O94826 608 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBP3P10745 1247 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1QTNF8P60827 252 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HTRA3P83110 453 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LONRF3Q496Y0 759 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RTP2Q5QGT7 225 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AACSQ86V21 672 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARAP2Q8WZ64 1704 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C14orf119Q9NWQ9 140 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LDHAP00338 332 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS12P25398 132 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP2C19P33261 490 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GMPRP36959 345 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRY1Q16526 586 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INF2Q27J81 1249 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LDHDQ86WU2 507 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARMC10Q8N2F6 343 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AGBL3Q8NEM8 1001 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPF2Q92785 391 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNF1Q9H3M0 494 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYOZ2Q9NPC6 264 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CATSPERZQ9NTU4 200 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM205AQ6ZU69 1335 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADM5C9JUS6 153 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYPP08247 313 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VCAM1P19320 739 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GTF2A2P52657 109 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms