RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 PRKCEQ02156 737 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 POU5F1BQ06416 359 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 TCF15Q12870 199 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 TCP11Q8WWU5 503 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 LENG9Q96B70 501 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 FAM20AQ96MK3 541 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 SAMM50Q9Y512 469 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 EYSQ5T1H1 3165 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PHKA2P46019 1235 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 GATMP50440 423 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 NEK4P51957 841 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PRR16Q569H4 304 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ZBTB33Q86T24 672 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PLXNA3P51805 1871 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PSMD10O75832 226 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CXCL14O95715 111 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 VTNP04004 478 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 FGFR1P11362 822 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CDC27P30260 824 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PSEN1P49768 467 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 BCAR1P56945 870 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PSMC5P62195 406 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD1Q15327 319 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 TERF2Q15554 542 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CLLU1OSQ5K130 101 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 RTL10Q7L3V2 364 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 NLRP7Q8WX94 980 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 GINS2Q9Y248 185 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 MSH4O15457 936 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 NRDCO43847 1150 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 DEXIO95424 95 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 RPS6KB1P23443 525 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CLCN3P51790 818 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PPP2R5CQ13362 524 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 RINLQ6ZS11 566 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 GPR149Q86SP6 731 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 HACE1Q8IYU2 909 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 STAMQ92783 540 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 IGSF21Q96ID5 467 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 SCLT1Q96NL6 688 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CEP89Q96ST8 783 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC66A2RUB6 948 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CDKL5O76039 1030 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 POU2F2P09086 479 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 XBP1P17861 261 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 NTRK3Q16288 839 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PGBD1Q96JS3 809 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 REV3LO60673 3130 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PER2O15055 1255 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF862O60290 1169 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms