RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNH6Q9H252 994 aa6.91□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.91□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.91□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMX2Q9Y320 296 aa6.91□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1W2PRG0 241 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 AKR1B10O60218 316 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARHGEF15O94989 841 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ASGR1P07306 291 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 CA3P07451 260 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ALCAMQ13740 583 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLS1Q14651 629 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 MIIPQ5JXC2 388 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 GJD3Q8N144 294 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 VWCEQ96DN2 955 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 PHOX2BQ99453 314 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 VCPKMTQ9H867 229 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYO6Q9UM54 1294 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP8B3O60423 1300 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDXKO00764 312 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADCY6O43306 1168 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAS7O60861 476 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM13AO94988 1023 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 EYA4O95677 639 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 FDX1P10109 184 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYP11B2P19099 503 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 NR2F2P24468 414 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIF11P52732 1056 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC12A3P55017 1021 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCL23P55773 120 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP2R5CQ13362 524 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC15Q8TF66 581 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATG4CQ96DT6 458 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 MMP19Q99542 508 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIPK3Q9H422 1215 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZBBXA8MT70 800 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 E9PMD0 336 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 LPXNO60711 386 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC25A27O95847 323 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFBP00751 764 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1P1-201ENST00000437111 SERPING1P05155 500 aa6.88□□□□□ -1.31
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