RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 PP2D1A8MPX8 630 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC36Q1X8D7 754 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ZBED8Q8IZ13 594 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 RNF217Q8TC41 542 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CCT8L2Q96SF2 557 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 EPN3Q9H201 632 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 TFDP1Q14186 410 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 NCAPHQ15003 741 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ANO5Q75V66 913 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 C1orf54Q8WWF1 131 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ARL8AQ96BM9 186 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 UBN1Q9NPG3 1134 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 KRT38O76015 456 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 KLC2Q9H0B6 622 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 IQCA1LA6NCM1 817 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 E9PMD0 336 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PEX3P56589 373 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SHC4Q6S5L8 630 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 MICALL2Q8IY33 904 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SLC44A5Q8NCS7 719 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 AGR3Q8TD06 166 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 GIPC2Q8TF65 315 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 FAM81BQ96LP2 452 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD7Q92527 254 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 NUP85Q9BW27 656 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 GRID2IPA4D2P6 1211 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 KIF28PB7ZC32 967 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 NR3C1P04150 777 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ELF1P32519 619 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CYTH1Q15438 398 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CCNYL1Q8N7R7 359 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 C11orf70Q9BRQ4 267 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 L3MBTL1Q9Y468 752 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 GRIN3BO60391 1043 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 RFX1P22670 979 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ARHGDIAP52565 204 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 NR1H3Q13133 447 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ACAD11Q709F0 780 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 OLFM3Q96PB7 478 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 KRT14P02533 472 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SOX5P35711 763 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 GPS1Q13098 491 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SPATA21Q7Z572 469 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 OR2W6PQ8NHA6 318 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CHP1Q99653 195 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PYGBP11216 843 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 Q3C1V9 767 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 KLC3Q6P597 504 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 AP5M1Q9H0R1 490 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC4Q9HBW1 653 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 STRIP2Q9ULQ0 834 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SNX5Q9Y5X3 404 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CDC27P30260 824 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 LONP2Q86WA8 852 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CHEK2O96017 543 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 RABGAP1LQ5R372 815 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 OTUD5Q96G74 571 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SUN2Q9UH99 717 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 DCCP43146 1447 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SYF2O95926 243 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PMLP29590 882 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 BBS5Q8N3I7 341 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 RPS6KC1Q96S38 1066 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CHN1P15882 459 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 KDSRQ06136 332 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 COASYQ13057 564 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ARHGAP10A1A4S6 786 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 GOLGA8RI6L899 631 aa15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms