RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LY9	Q9HBG7	655 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC188	H7C350	402 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RASGRF2	O14827	1237 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP9B	O43861	1147 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDK4	P11802	303 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADRA2B	P18089	450 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EMP3	P54852	163 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTFR1	Q15390	333 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	METTL13	Q8N6R0	699 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMC6	Q96SB8	1091 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM196B	A6NMK8	535 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	P4HA2	O15460	535 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EYA4	O95677	639 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GNAT2	P19087	354 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMARCA1	P28370	1054 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TXK	P42681	527 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP11	P51784	963 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLTP	P55058	493 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTGDR	Q13258	359 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MPP2	Q14168	576 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VWA3B	Q502W6	1294 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VSTM1	Q6UX27	236 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NME8	Q8N427	588 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SETDB2	Q96T68	719 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BTBD7	Q9P203	1132 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	APBA3	O96018	575 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GRIA2	P42262	883 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RASSF2	P50749	326 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLRC3	Q07444	240 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NARF	Q9UHQ1	456 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PSMG1	O95456	288 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ALDH2	P05091	517 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDXDC1	Q6P996	788 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MIPEP	Q99797	713 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TLE6	Q9H808	572 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NR2E1	Q9Y466	385 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPTOR	Q8N122	1335 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GNPAT	O15228	680 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTPN4	P29074	926 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IL17A	Q16552	155 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NLRP10	Q86W26	655 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TREML1	Q86YW5	311 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERMN	Q8TAM6	284 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ESR2	Q92731	530 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61

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