RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 PCNTO95613 3336 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 E9PSI1 815 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 MATN2O00339 956 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 PLSCR1O15162 318 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 EFCAB14O75071 495 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 ADCY8P40145 1251 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 PRELPP51888 382 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 DUSP8Q13202 625 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 GPR162Q16538 588 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 Q6ZSN1 163 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 WDR48Q8TAF3 677 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 FAM89AQ96GI7 184 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 MTFR1LQ9H019 292 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 KCNK3O14649 394 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 MPIG6BO95866 241 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 ECE1P42892 770 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 NRN1LQ496H8 165 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 KANK2Q63ZY3 851 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 USP30Q70CQ3 517 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF503Q96F45 646 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 OR14A2Q96R54 314 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 AMNQ9BXJ7 453 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 OR10A5Q9H207 317 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 A0A0G2JNJ9 132 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 TBR1Q16650 682 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 Q9UFV3 132 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 A0A1W2PP64 1363 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 MMEP08473 750 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 MEOX1P50221 254 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 CD83Q01151 205 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 KLF10Q13118 480 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 SERINC3Q13530 473 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 RASA3Q14644 834 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 PCOLCEQ15113 449 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 SEC23AQ15436 765 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 CFHR4Q92496 578 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 ARMC5Q96C12 935 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 OR10A2Q9H208 303 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 PANK3Q9H999 370 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 ASB1Q9Y576 335 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 ATP10DQ9P241 1426 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-205ENST00000427193 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 SCDO00767 359 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 MRE11P49959 708 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 ASB15Q8WXK1 588 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 EXTL1Q92935 676 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 NELFAQ9H3P2 528 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 MOGSQ13724 837 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 SLC15A2Q16348 729 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 GRAMD4Q6IC98 578 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 GBP4Q96PP9 640 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 MENTQ9BUN1 341 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 USP35Q9P2H5 1018 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-205ENST00000427193 USP6P35125 1406 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms