RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 AXLP30530 894 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 PSMD2Q13200 908 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 DSC3Q14574 896 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 TCTN1Q2MV58 587 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 TET1Q8NFU7 2136 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 ERLIN2O94905 339 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 SMC2O95347 1197 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 EDN1P05305 212 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM240Q5SV17 173 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 EXOC1Q9NV70 894 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 EFCAB14O75071 495 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 PIGRP01833 764 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 ACRP10323 421 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 CASP5P51878 434 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 HPS3Q969F9 1004 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 SMARCE1Q969G3 411 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC51Q96ER9 411 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.181e-6■■■■□ 20.4
TSTA3-201ENST00000425753 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 RMND1Q9NWS8 449 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 TBX20Q9UMR3 447 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 B4GALT5O43286 388 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 GCNT3O95395 438 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 ACTN1P12814 892 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 BMP8BP34820 402 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 IKBKEQ14164 716 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 ZPBP2Q6X784 338 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF365Q70YC5 407 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 UBE4BO95155 1302 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 A0A1B0GUA9 196 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 MGEA5O60502 916 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 FGBP02675 491 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 MYBP10242 640 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 STRN3Q13033 797 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 STK4Q13043 487 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 RASIP1Q5U651 963 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 NOTUMQ6P988 496 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 HERVK_113Q902F9 699 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 PRO3102Q9H379 93 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 RGS18Q9NS28 235 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.39■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 CAMK4Q16566 473 aa22.39■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.39■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.39■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.39■■□□□ 1.18
TSTA3-201ENST00000425753 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 PROZP22891 400 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ADAM2Q99965 735 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 C9IYK1 514 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ENPP3O14638 875 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ABLIM1O14639 778 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 ACCSQ96QU6 501 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM206Q9H813 350 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.38■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 A0A0U1RQF3 1178 aa22.37■■□□□ 1.17
TSTA3-201ENST00000425753 N4BP3O15049 544 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms