RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416464.6

TRIM16-202, Transcript of tripartite motif containing 16, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRIM16, Length 3,184 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16-202ENST00000416464 USP1O94782 785 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 RASSF2P50749 326 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 MTA1Q13330 715 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 ZNF365Q70YC5 407 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 GLYCTKQ8IVS8 523 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 LRMDAQ9H2I8 198 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 VCX3BQ9H321 246 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 CCDC134Q9H6E4 229 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 VCX3AQ9NNX9 186 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 ZNF711Q9Y462 761 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 RTL9Q8NET4 1388 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 FLT1P17948 1338 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 SIGLEC16A6NMB1 481 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 TOM1O60784 492 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 WFS1O76024 890 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 LYNP07948 512 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 DESP17661 470 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 SERPINB3P29508 390 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 CHKAP35790 457 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 PTENP60484 403 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 MTMR2Q13614 643 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 ALX1Q15699 326 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 KRT35Q92764 455 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 PTPRN2Q92932 1015 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 MPP4Q96JB8 637 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 TSG101Q99816 390 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 SPATA16Q9BXB7 569 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 AKAP11Q9UKA4 1901 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 CASZ1Q86V15 1759 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 O00370 1275 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 KCNH2Q12809 1159 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 MAPK7Q13164 816 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 PPFIBP2Q8ND30 876 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 DDX12PQ92771 950 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 NPHS2Q9NP85 383 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 USP40Q9NVE5 1235 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 BTG4Q9NY30 223 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 MARK3P27448 753 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 GALK1P51570 392 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 CDR2Q01850 454 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 GIT2Q14161 759 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 TMED2Q15363 201 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 MTFR1Q15390 333 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 C4orf33Q8N1A6 199 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 PIGBQ92521 554 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 ARHGEF26Q96DR7 871 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 C9orf72Q96LT7 481 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 USP17L12C9JPN9 530 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 USP17L21D6R901 530 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 PGM3O95394 542 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 BAG3O95817 575 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 CYP2D6P10635 497 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 TRAPPC10P48553 1259 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-202ENST00000416464 CYP4F22Q6NT55 531 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms