RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412722.1

LINC00427-201, long intergenic non-protein coding RNA 427, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00427, Length 430 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00427-201ENST00000412722 FSTP19883 344 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 HTR1BP28222 390 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 PEX2P28328 305 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 HALP42357 657 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 ECE1P42892 770 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 GPR15P49685 360 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 CDK17Q00537 523 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 SLC6A3Q01959 620 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 MALLQ13021 153 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 MYBPC3Q14896 1274 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 BICRALQ6AI39 1079 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 MILR1Q7Z6M3 343 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 CPXCR1Q8N123 301 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 STK11IPQ8N1F8 1099 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 OXR1Q8N573 874 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 CALML6Q8TD86 181 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 PEX11GQ96HA9 241 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 SYT17Q9BSW7 474 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 RSAD1Q9HA92 442 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 KMT5AQ9NQR1 393 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 BTBD7Q9P203 1132 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 PRSS50Q9UI38 385 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 DENND2AQ9ULE3 1009 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 IPPQ9Y573 584 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 UGGT1Q9NYU2 1555 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 ITSN2Q9NZM3 1697 aa5.5□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 MYPNQ86TC9 1320 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 FITM1A5D6W6 292 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 CCDC154A6NI56 674 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 RASA4BC9J798 803 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 F5H423 210 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 SRGAP3O43295 1099 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 RASA4O43374 803 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 ALDH2P05091 517 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 CYP4F8P98187 520 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 GRIN1Q05586 938 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 NR0B2Q15466 257 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 CCDC178Q5BJE1 867 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 RALGPS1Q5JS13 557 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 BRINP3Q76B58 766 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 DAAM2Q86T65 1068 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 DPP9Q86TI2 863 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 PAF1Q8N7H5 531 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 DEPTORQ8TB45 409 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 LRTOMTQ8WZ04 291 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 HDAC10Q969S8 669 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 CGRRF1Q99675 332 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 PNMA2Q9UL42 364 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 POLHQ9Y253 713 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 GOLGA3Q08378 1498 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 UNC13BO14795 1591 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 ADGBQ8N7X0 1667 aa5.49□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 SETD5Q9C0A6 1442 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 ARHGAP23Q9P227 1491 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 SLC16A6O15403 523 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 ZBTB7AO95365 584 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 CD53P19397 219 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 EDNRBP24530 442 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 ARL4AP40617 200 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 GPSM2P81274 684 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 PPARAQ07869 468 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 SNX17Q15036 470 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 ADRM1Q16186 407 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 MUM1L1Q5H9M0 696 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 PPP4R3AQ6IN85 833 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 MAEAQ7L5Y9 396 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 KRT27Q7Z3Y8 459 aa5.48□□□□□ -1.53
LINC00427-201ENST00000412722 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms