RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 KLHL7Q8IXQ5 586 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 C4orf19Q8IY42 314 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 KLRG1Q96E93 195 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 IKZF4Q9H2S9 585 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 FDX1P10109 184 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 VAMP7P51809 220 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ERVK-9P63128 1117 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 KSR1Q8IVT5 923 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 HVCN1Q96D96 273 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.74■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 OTOFQ9HC10 1997 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 TRIM49P0CI25 452 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 TRIM49CP0CI26 452 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 EPC2Q52LR7 807 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 SPDYCQ5MJ68 293 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 KDM7AQ6ZMT4 941 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ARL8AQ96BM9 186 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 AGPAT1Q99943 283 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 FAM107BQ9H098 131 aa25.73■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ESYT3A0FGR9 886 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ZNF233A6NK53 670 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ECHS1P30084 290 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 MTMR3Q13615 1198 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 PLS1Q14651 629 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 CST9Q5W186 159 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 RDM1Q8NG50 284 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 COL20A1Q9P218 1284 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 SFNP31947 248 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ENPEPQ07075 957 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 MORC4Q8TE76 937 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 FAM114A2Q9NRY5 505 aa25.72■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ZEB2O60315 1214 aa25.71■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 JAK3P52333 1124 aa25.71■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 C11orf63Q6NUN7 778 aa25.71■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB9Q96C00 473 aa25.71■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 HOOK2Q96ED9 719 aa25.71■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.71■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 HSPA6P17066 643 aa25.7■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 NCKAP1LP55160 1127 aa25.7■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 WRNIP1Q96S55 665 aa25.7■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.7■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 GOLPH3Q9H4A6 298 aa25.7■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 EMSYQ7Z589 1322 aa25.7■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 PASKQ96RG2 1323 aa25.7■■□□□ 1.71
PMS1-205ENST00000409985 MYO1CO00159 1063 aa25.7■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 MTA2O94776 668 aa25.7■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 MTMR1Q13613 665 aa25.7■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 DCAF15Q66K64 600 aa25.7■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 EXOC7Q9UPT5 735 aa25.7■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 NFIBO00712 420 aa25.69■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 TOMM70O94826 608 aa25.69■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 GZMAP12544 262 aa25.69■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 SLC20A2Q08357 652 aa25.69■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.69■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa25.69■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 GRIN2DO15399 1336 aa25.69■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 GUCY2FP51841 1108 aa25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 PTENP60484 403 aa25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 PSMC5P62195 406 aa25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 KRT76Q01546 638 aa25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 EFCAB13Q8IY85 973 aa25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 RPS6KC1Q96S38 1066 aa25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 AP1M1Q9BXS5 423 aa25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 RAB17Q9H0T7 212 aa25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 OSGEPQ9NPF4 335 aa25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 HSPBP1Q9NZL4 362 aa25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 IL31RAQ8NI17 732 aa25.68■■□□□ 1.7
PMS1-205ENST00000409985 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
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