RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409178.5

C10orf55-201, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C10orf55, Length 2,513 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-201ENST00000409178 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ADSSP30520 456 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 NCKAP1LP55160 1127 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CFAP58Q5T655 872 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ANO5Q75V66 913 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 IQCKQ8N0W5 287 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 SH2D3CQ8N5H7 860 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ISCUQ9H1K1 167 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ACP6Q9NPH0 428 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 RFX1P22670 979 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 PPFIA1Q13136 1202 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 NAA35Q5VZE5 725 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 KCTD16Q68DU8 428 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 RNF146Q9NTX7 359 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 NR2E1Q9Y466 385 aa23.38■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 MXI1P50539 228 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 JAK3P52333 1124 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CETN1Q12798 172 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 MICALL2Q8IY33 904 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ELMO3Q96BJ8 720 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 NEUROG2Q9H2A3 272 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 HACL1Q9UJ83 578 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ANKRD62A6NC57 917 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 FGGP02679 453 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 MREGQ8N565 214 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 WHAMMQ8TF30 809 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 BSNDQ8WZ55 320 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 NPTX2P47972 431 aa23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 SEMA4DQ92854 862 aa23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 TBX20Q9UMR3 447 aa23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 NFKBIEO00221 500 aa23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 SORBS3O60504 671 aa23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 SGPL1O95470 568 aa23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 KRT76Q01546 638 aa23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.36■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 P4HA2O15460 535 aa23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 TTI1O43156 1089 aa23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 PCDHB18PQ96TA0 734 aa23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 IVLP07476 585 aa23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 COPB2P35606 906 aa23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 SP4Q02446 784 aa23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 SKIDA1Q1XH10 827 aa23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 KREMEN1Q96MU8 473 aa23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 LCMT1Q9UIC8 334 aa23.35■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC188H7C350 402 aa23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF862O60290 1169 aa23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 SFNP31947 248 aa23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 PPM1KQ8N3J5 372 aa23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ALG3Q92685 438 aa23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 DENND3A2RUS2 1198 aa23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 NR3C2P08235 984 aa23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 TIPINQ9BVW5 301 aa23.34■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 DAPK3O43293 454 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 ZBTB7AO95365 584 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CHRNB2P17787 502 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 BACE1P56817 501 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CUL1Q13616 776 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 AADACL2Q6P093 401 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 NLRX1Q86UT6 975 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 FAM84AQ96KN4 292 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 RABEP2Q9H5N1 569 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms