RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 HERVK_113P62684 666 aa6.66□□□□□ -1.34
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C6orf48-208ENST00000395788 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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C6orf48-208ENST00000395788 C4orf19Q8IY42 314 aa6.66□□□□□ -1.34
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C6orf48-208ENST00000395788 FIZ1Q96SL8 496 aa6.66□□□□□ -1.34
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C6orf48-208ENST00000395788 STRA6Q9BX79 667 aa6.66□□□□□ -1.34
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C6orf48-208ENST00000395788 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.66□□□□□ -1.34
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C6orf48-208ENST00000395788 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ASTN1O14525 1302 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 PFASO15067 1338 aa6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.65□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.65□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 N4BP3O15049 544 aa6.65□□□□□ -1.34
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C6orf48-208ENST00000395788 STBD1O95210 358 aa6.65□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 ATG7O95352 703 aa6.65□□□□□ -1.34
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C6orf48-208ENST00000395788 TPH2Q8IWU9 490 aa6.65□□□□□ -1.34
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C6orf48-208ENST00000395788 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.65□□□□□ -1.34
C6orf48-208ENST00000395788 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.65□□□□□ -1.34
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C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB39O15060 712 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 CHMP2AO43633 222 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 STX10O60499 249 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 MFAP3LO75121 409 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 GNA14O95837 355 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 GYPCP04921 128 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 RSPH10BP0C881 870 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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