RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM139Q8IV31 216 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 BICD1Q96G01 975 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 FBXL18Q96ME1 805 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 PANX2Q96RD6 677 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 TTC26A0AVF1 554 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MYADML2A6NDP7 307 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 GNRH1P01148 92 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 TPM1P09493 284 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 NKX3-2P78367 333 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 BFSP1Q12934 665 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 TFDP1Q14186 410 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 SETD4Q9NVD3 440 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 NRCAMQ92823 1304 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MSCO60682 206 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MYL3P08590 195 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 TMOD1P28289 359 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 PSEN2P49810 448 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 LIG4P49917 911 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 POU5F1BQ06416 359 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 RDH13Q8NBN7 331 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 IQCDQ96DY2 449 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC51Q96ER9 411 aa22.17■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.16■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 PTENP60484 403 aa22.16■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 NLRP4Q96MN2 994 aa22.16■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.16■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 USP20Q9Y2K6 914 aa22.16■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 ADRB2P07550 413 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 ZPBP2Q6X784 338 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 SAAL1Q96ER3 474 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 ERO1AQ96HE7 468 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 A0A1W2PQJ5 194 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 EPHB6O15197 1021 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 NRDCO43847 1150 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 FKTNO75072 461 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 HMGCRP04035 888 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 RARBP10826 455 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 FECHP22830 423 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 KRT9P35527 623 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 ADAM17P78536 824 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MAPK6Q16659 721 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 FZD8Q9H461 694 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 KPNA6O60684 536 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 KRT13P13646 458 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 GPD1LQ8N335 351 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 AKT3Q9Y243 479 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 STX10O60499 249 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 ADAMTS4O75173 837 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 PRKCBP05771 671 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM49P0CI25 452 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM49CP0CI26 452 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-202ENST00000394272 VAMP7P51809 220 aa22.13■■□□□ 1.13
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