RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 CPB2Q96IY4 423 aa22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 CLDND1Q9NY35 253 aa22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 DNM3Q9UQ16 869 aa22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 LTBRP36941 435 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 ERVFC1P60507 584 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 CSRNP2Q9H175 543 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 RSAD1Q9HA92 442 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 SPG21Q9NZD8 308 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 E9PMD0 336 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 EYA4O95677 639 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.247e-7■■■■■ 27.5
UBE2E3-201ENST00000392415 NAMPTP43490 491 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 BCAR1P56945 870 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT17Q04695 432 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 HYIQ5T013 277 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 BSNDQ8WZ55 320 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 FZD8Q9H461 694 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 IPPQ9Y573 584 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A1B0GUA9 196 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 CARNS1A5YM72 827 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 FSCN2O14926 492 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 B4GALT5O43286 388 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAM15Q13444 863 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP2R5AQ15172 486 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM187BQ17R55 369 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 KIFAP3Q92845 792 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 IGFLR1Q9H665 355 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 C5orf42Q9H799 3197 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 TNFRSF10AO00220 468 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.244e-6■■■□□ 17
UBE2E3-201ENST00000392415 BMP15O95972 392 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGA4P13612 1032 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNK18Q7Z418 384 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 URGCPQ8TCY9 931 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2E3-201ENST00000392415 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 GALTP07902 379 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 SYT1P21579 422 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 EFHBQ8N7U6 833 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 IFT74Q96LB3 600 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 AK8Q96MA6 479 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 PNMA5Q96PV4 448 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF39Q9H2S5 420 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 POLD4Q9HCU8 107 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 INPPL1O15357 1258 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 LINC01565O15544 149 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 NRIP1P48552 1158 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 MAPK6Q16659 721 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 DEPTORQ8TB45 409 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 SNX21Q969T3 373 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM169Q96HH4 297 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 TCF25Q9BQ70 676 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 TLE6Q9H808 572 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 HES2Q9Y543 173 aa22.75■■□□□ 1.23
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