RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378839.1

CCDC3-202, Transcript of coiled-coil domain containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCDC3, Length 3,180 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC3-202ENST00000378839 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 ZNF233A6NK53 670 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 PEX10O60683 326 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 KRT14P02533 472 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 MYBPC2Q14324 1141 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 IQCKQ8N0W5 287 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 PBKQ96KB5 322 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 SGPL1O95470 568 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 CALCAP01258 141 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 LMNB1P20700 586 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 COPB2P35606 906 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 FLT3P36888 993 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 NPTX2P47972 431 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 XKR9Q5GH70 373 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 AGPAT1Q99943 283 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 TMEM206Q9H813 350 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 USP20Q9Y2K6 914 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 PSMC5P62195 406 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 VPS36Q86VN1 386 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 JDP2Q8WYK2 163 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 RNF146Q9NTX7 359 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 FSTL1Q12841 308 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 RFFLQ8WZ73 363 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 ALG3Q92685 438 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 AMACRQ9UHK6 382 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 TBX20Q9UMR3 447 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 BACE1P56817 501 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 TNIP1Q15025 636 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 WDR81Q562E7 1941 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 KRT13P13646 458 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 KCNA2P16389 499 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 PTPRAP18433 802 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 TNFAIP3P21580 790 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 MARCKSL1P49006 195 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 NAA35Q5VZE5 725 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 WDR64B1ANS9 1081 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 NR3C2P08235 984 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 HMGCS2P54868 508 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 DLK2Q6UY11 383 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 CCDC169A6NNP5 214 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 KRIT1O00522 736 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 ZBED4O75132 1171 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 NNTQ13423 1086 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 DOCK1Q14185 1865 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 RPS6KA5O75582 802 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 CNGA1P29973 690 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 SP2Q02086 613 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 SP4Q02446 784 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC3-202ENST00000378839 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms