RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB7AO95365 584 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 CFLARO15519 480 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 STMN1P16949 149 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ESRRGP62508 458 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 MMP19Q99542 508 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF609O15014 1411 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ASB14A6NK59 587 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 GSTA4O15217 222 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 PMS2P54278 862 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 NYAP2Q9P242 653 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 FLT1P17948 1338 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 GUCY2CP25092 1073 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 LPAR1Q92633 364 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEB5Q9BZ81 275 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 RGL1Q9NZL6 768 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 TBX3O15119 743 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 NCK2O43639 380 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 MX2P20592 715 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 KYAT1Q16773 422 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ACAP3Q96P50 834 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 BFARQ9NZS9 450 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 SUN2Q9UH99 717 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0G2JND7 137 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 KPNA7A9QM74 516 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 DGAT1O75907 488 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 GGPS1O95749 300 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFB10O96000 172 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 RPSAP08865 295 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 COG2Q14746 738 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ADSSL1Q8N142 457 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 PPME1Q9Y570 386 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 PPFIA2O75334 1257 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ENTPD3O75355 529 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 TAP1Q03518 808 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 SMARCA1P28370 1054 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 STAT5BP51692 787 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 HMGCS2P54868 508 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 XKR3Q5GH77 459 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ESYT3A0FGR9 886 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 A8MXQ7 604 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 PHEXP78562 749 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 CAMTA2O94983 1202 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 GGCXP38435 758 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 RNF181Q9P0P0 153 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 FAM47EQ6ZV65 393 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC138Q96M89 665 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 GPS1Q13098 491 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 EFHC2Q5JST6 749 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GTH6 734 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 CSPG5O95196 566 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 KRT80Q6KB66 452 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF560Q96MR9 790 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 PARVAQ9NVD7 372 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 RHOBTB3O94955 611 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 TERF2Q15554 542 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 PPM1NQ8N819 430 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 RNF149Q8NC42 400 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 AGPAT1Q99943 283 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 USP27XA6NNY8 438 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8MH3BSY2 632 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K7O43318 606 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 SLC26A4O43511 780 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-203ENST00000366687 CREB3O43889 395 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms