RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 B4GALT5O43286 388 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 STX6O43752 255 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 OFD1O75665 1012 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 FGF18O76093 207 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 CSPG5O95196 566 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP2R5AQ15172 486 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 CABP7Q86V35 215 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF558Q96NG5 402 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 PLIN2Q99541 437 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 CSRNP2Q9H175 543 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 CLIC4Q9Y696 253 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 DLL1O00548 723 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 PBX3P40426 434 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 UBE3AQ05086 875 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 GRIN1Q05586 938 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 PTPAQ15257 358 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM187BQ17R55 369 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 AAK1Q2M2I8 961 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 CNNM3Q8NE01 707 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 DEPTORQ8TB45 409 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 IFT74Q96LB3 600 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 FZD8Q9H461 694 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 RSAD1Q9HA92 442 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 IPPQ9Y573 584 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC26A4O43511 780 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 IRS1P35568 1242 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 UBA7P41226 1012 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 DAW1Q8N136 415 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 A0A1B0GUA9 196 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 HIP1RO75146 1068 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 PRKCBP05771 671 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 ITGA4P13612 1032 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 PPM1AP35813 382 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNQ1P51787 676 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 PLCB3Q01970 1234 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 MAPK7Q13164 816 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 MAPK6Q16659 721 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 CALML4Q96GE6 196 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 SPG21Q9NZD8 308 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 NPTXRO95502 500 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC12A3P55017 1021 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 BCAR1P56945 870 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 COL19A1Q14993 1142 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 URGCPQ8TCY9 931 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 DRC1Q96MC2 740 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 RNF39Q9H2S5 420 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 TLR9Q9NR96 1032 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 LZTS1Q9Y250 596 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 HES2Q9Y543 173 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP5-201ENST00000366391 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 ACKR2O00590 384 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 EDN1P05305 212 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 PLA2G4BP0C869 781 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 LIG1P18858 919 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 GUCY2CP25092 1073 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP5-201ENST00000366391 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms