RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 FGD4Q96M96 766 aa20.17■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 PORCNQ9H237 461 aa20.17■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.17■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 SLC25A27O95847 323 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 NR3C1P04150 777 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 SCP2P22307 547 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 STXBP2Q15833 593 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 NEK9Q8TD19 979 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 ZIM3Q96PE6 472 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 STIM2Q9P246 746 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 PNMA3Q9UL41 463 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 NOL4O94818 638 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 ATP1A2P50993 1020 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 HUNKP57058 714 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 PTGISQ16647 500 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 SPRYD7Q5W111 196 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 CEP63Q96MT8 703 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 HINFPQ9BQA5 517 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 STRA6Q9BX79 667 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 PDXKO00764 312 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 PPP1R37O75864 691 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 GAP43P17677 238 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 PSMC5P62195 406 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 KRT76Q01546 638 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 GNPTABQ3T906 1256 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 C4orf19Q8IY42 314 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 IWS1Q96ST2 819 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 ACTR2P61160 394 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 XKR9Q5GH70 373 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 CEP85LQ5SZL2 805 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 TRIM58Q8NG06 486 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 FAM212AQ96EL1 285 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 CETN3O15182 167 aa20.14■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 LYPLA2O95372 231 aa20.14■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 KIF5AQ12840 1032 aa20.14■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 KCTD2Q14681 263 aa20.14■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.14■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.14■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 MMP19Q99542 508 aa20.14■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 MAF1Q9H063 256 aa20.14■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.14■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.14■□□□□ 0.82
SNX11-201ENST00000359238 MAFGO15525 162 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 ATP4AP20648 1035 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 JAK3P52333 1124 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 VAV2P52735 878 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 KCNH2Q12809 1159 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 CHADLQ6NUI6 762 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 NLRP14Q86W24 1093 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 CD302Q8IX05 232 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 IQCKQ8N0W5 287 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 BSNDQ8WZ55 320 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 BAP1Q92560 729 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 CCT8L2Q96SF2 557 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 PTPN18Q99952 460 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 STAM2O75886 525 aa20.13■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 ACTN1P12814 892 aa20.13■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 CDR1P51861 262 aa20.13■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 SLC7A5Q01650 507 aa20.13■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.13■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.13■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.13■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 K7ENM7 598 aa20.13■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 ARIH2O95376 493 aa20.13■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 FAM107AO95990 144 aa20.13■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 GUCY1A3Q02108 690 aa20.13■□□□□ 0.81
SNX11-201ENST00000359238 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms