RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 FSTL1Q12841 308 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 MOGSQ13724 837 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 STXBP2Q15833 593 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 WLSQ5T9L3 541 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 RRAGAQ7L523 313 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 OPTNQ96CV9 577 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 CEP72Q9P209 647 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 STIM2Q9P246 746 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 RNF14Q9UBS8 474 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-204ENST00000352260 ICAM3P32942 547 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 C2orf54Q08AI8 447 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 TTMPQ5BVD1 217 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ANO5Q75V66 913 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 BORCS6Q96GS4 357 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 MCM8Q9UJA3 840 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF862O60290 1169 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 STBD1O95210 358 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 PSAPP07602 524 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ALCAMQ13740 583 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 DMAC2Q9NW81 257 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ZMYND10O75800 440 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ACTR2P61160 394 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 SP4Q02446 784 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 SORBS3O60504 671 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 RASSF9O75901 435 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 LSP1P33241 339 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 SP2Q02086 613 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 CHADLQ6NUI6 762 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 GANQ9H2C0 597 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 TSKSQ9UJT2 592 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.17■□□□□ 0.82
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SPNS1-204ENST00000352260 CYP2J2P51589 502 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 NAA35Q5VZE5 725 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 SLC35C1Q96A29 364 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 KLC4Q9NSK0 619 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 EDNRBP24530 442 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ELF1P32519 619 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 GJA5P36382 358 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 IFT20Q8IY31 132 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 IQCKQ8N0W5 287 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ACCSQ96QU6 501 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM206Q9H813 350 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 WDR81Q562E7 1941 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 SLC25A27O95847 323 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 PAFAH1B1P43034 410 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 NCKAP1LP55160 1127 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 PEX3P56589 373 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 PDCLQ13371 301 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 SPA17Q15506 151 aa20.16■□□□□ 0.82
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