RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 EMC10Q5UCC4 262 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 PADI6Q6TGC4 694 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.86□□□□□ -1.15
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PTPRR-202ENST00000342084 JAMLQ86YT9 394 aa7.86□□□□□ -1.15
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PTPRR-202ENST00000342084 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.86□□□□□ -1.15
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PTPRR-202ENST00000342084 UGCGQ16739 394 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 ICE2Q659A1 982 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 DUPD1Q68J44 220 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRR-202ENST00000342084 SELENOSQ9BQE4 189 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 ERP44Q9BS26 406 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 TXLNGYQ9BZA5 131 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM39BQ9GZU3 492 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 VEZTQ9HBM0 779 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRR-202ENST00000342084 H0YHG0 523 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRR-202ENST00000342084 ENTPD3O75355 529 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 RAD17O75943 681 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 MMEP08473 750 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 PYGMP11217 842 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRR-202ENST00000342084 CPXCR1Q8N123 301 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRR-202ENST00000342084 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 SEMA4DQ92854 862 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 AKT1S1Q96B36 256 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 PSMD1Q99460 953 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 STRA6Q9BX79 667 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 RAB17Q9H0T7 212 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 CARD9Q9H257 536 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 AZI2Q9H6S1 392 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRR-202ENST00000342084 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.85□□□□□ -1.15
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