RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340067.3

KCTD21-201, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD21, Length 3,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD21-201ENST00000340067 DLEC1Q9Y238 1755 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 DGAT1O75907 488 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 VTNP04004 478 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 OATP04181 439 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 PIK3CAP42336 1068 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 GYS2P54840 703 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 MESDQ14696 234 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 CEP112Q8N8E3 955 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 ARFGAP3Q9NP61 516 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 FDX1P10109 184 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 ADORA2AP29274 412 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 ERVK-9P63128 1117 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 PPATQ06203 517 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 PEX26Q7Z412 305 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 CHST13Q8NET6 341 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 NEK9Q8TD19 979 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 AFG1LQ8WV93 481 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 TATDN2Q93075 761 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 TTYH3Q9C0H2 523 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 OSGEPQ9NPF4 335 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 SEL1LQ9UBV2 794 aa11.66□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 SIPA1L1O43166 1804 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 ERICH4A6NGS2 130 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 CLDN3O15551 220 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 BCRP11274 1271 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 CD19P15391 556 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 GUCY2CP25092 1073 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 COPB2P35606 906 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 FAM160B1Q5W0V3 765 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 SESTD1Q86VW0 696 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 PALB2Q86YC2 1186 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 CEP120Q8N960 986 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 BTBD6Q96KE9 485 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 MYH11P35749 1972 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 TADA3O75528 432 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 NEDD9Q14511 834 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 TRIM58Q8NG06 486 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD21-201ENST00000340067 ZNF233A6NK53 670 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 WDR44Q5JSH3 913 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 NLRP7Q8WX94 980 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 EFCAB8A8MWE9 144 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 BTBD19C9JJ37 291 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 PIK3R2O00459 728 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 GJA5P36382 358 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 REPS2Q8NFH8 660 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 GOLGA5Q8TBA6 731 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 KIFAP3Q92845 792 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 NT5C1BQ96P26 610 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 APEX2Q9UBZ4 518 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 SGPL1O95470 568 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 CYP2C19P33261 490 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 EFCAB12Q6NXP0 572 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 ILDR2Q71H61 639 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 ARMCX2Q7L311 632 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 RNF169Q8NCN4 708 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 IMPG2Q9BZV3 1241 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 TMEM117Q9H0C3 514 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 RABEP2Q9H5N1 569 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 C1orf112Q9NSG2 853 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 TMOD1P28289 359 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD21-201ENST00000340067 TNFSF9P41273 254 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms