RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330298.6

CTNNA3-201, Transcript of catenin alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene CTNNA3, Length 696 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3-201ENST00000330298 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.69□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.69□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 URGCPQ8TCY9 931 aa14.69□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 SUSD6Q92537 303 aa14.69□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 LPPQ93052 612 aa14.69□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 IGSF21Q96ID5 467 aa14.69□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 KIF2CQ99661 725 aa14.69□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.69□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.69□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 ARID2Q68CP9 1835 aa14.69□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 INPPL1O15357 1258 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 GALTP07902 379 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 MUTP22033 750 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 MCM7P33993 719 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 C8orf34Q49A92 452 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 NOTUMQ6P988 496 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 CASP10Q92851 521 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 NACC1Q96RE7 527 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 S1PR5Q9H228 398 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 RSAD1Q9HA92 442 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.68□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 POTEMA6NI47 508 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 TSPAN1O60635 241 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 CTSAP10619 480 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 RPA1P27694 616 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 TECP42680 631 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 GUCY1B3Q02153 619 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 CAPSQ13938 189 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 RNF135Q8IUD6 432 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 VPS52Q8N1B4 723 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 ERMNQ8TAM6 284 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 ZBP1Q9H171 429 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.67□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 CXCL14O95715 111 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 ALDH2P05091 517 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 OR52Z1P0C646 297 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 ITGA4P13612 1032 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 ATP2B1P20020 1258 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 GLRA2P23416 452 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 AMHR2Q16671 573 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 LONRF3Q496Y0 759 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 HACE1Q8IYU2 909 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 CSRNP2Q9H175 543 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 IPPQ9Y573 584 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 STK24Q9Y6E0 443 aa14.66□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 MED24O75448 989 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 SLC11A1P49279 550 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 ITIH3Q06033 890 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 RABEP1Q15276 862 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 ZNF174Q15697 407 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 TTC38Q5R3I4 469 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.65□□□□□ -0.06
CTNNA3-201ENST00000330298 A0A1B0GUA9 196 aa14.64□□□□□ -0.07
CTNNA3-201ENST00000330298 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTNNA3-201ENST00000330298 ARL5CA6NH57 179 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms