RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RAB11B-201ENST00000328024 TTC3P53804 2025 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11B-201ENST00000328024 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB11B-201ENST00000328024 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF202O95125 648 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11B-201ENST00000328024 NCKAP1LP55160 1127 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11B-201ENST00000328024 FAM189BP81408 668 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11B-201ENST00000328024 FAM187BQ17R55 369 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11B-201ENST00000328024 UBXN11Q5T124 520 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11B-201ENST00000328024 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB11B-201ENST00000328024 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11B-201ENST00000328024 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB11B-201ENST00000328024 CHST12Q9NRB3 414 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB11B-201ENST00000328024 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 ERLIN2O94905 339 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 UPP2O95045 317 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 MYOGP15173 224 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 CUL4BQ13620 913 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 SFR1Q86XK3 245 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 PRKCBP05771 671 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 IDEP14735 1019 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 MAPK6Q16659 721 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.2■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 K7ERI5 159 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 ACKR2O00590 384 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 GJB5O95377 273 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 EFNA5P52803 228 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.142e-7■■■■□ 22
RAB11B-201ENST00000328024 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 PBX4Q9BYU1 374 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 PANK4Q9NVE7 773 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 USP25Q9UHP3 1055 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 SMTNP53814 917 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 AMPD3Q01432 767 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 HPS3Q969F9 1004 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 LRCH3Q96II8 777 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 GBF1Q92538 1859 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 A0A0U1RQF3 1178 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1B0GUA9 196 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 NR1I2O75469 434 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 PRR29P0C7W0 189 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 GPT2Q8TD30 523 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 COL4A6Q14031 1691 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 ARHGEF15O94989 841 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 AXLP30530 894 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 GATMP50440 423 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 ASIC1P78348 528 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 COASYQ13057 564 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 CNNM3Q8NE01 707 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 KCNN1Q92952 543 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 DACT1Q9NYF0 836 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 LCHNA4D1U4 455 aa22.16■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.16■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 K7ENM7 598 aa22.16■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 KLRC4O43908 158 aa22.16■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 CASP5P51878 434 aa22.16■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.16■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.16■■□□□ 1.14
RAB11B-201ENST00000328024 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.16■■□□□ 1.14
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