RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311160.13

TNS3-201, Transcript of tensin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS3, Length 7,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-201ENST00000311160 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 TBKBP1A7MCY6 615 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 NCAM1P13591 858 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 PDHA2P29803 388 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 MICALL2Q8IY33 904 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 SPACA7Q96KW9 195 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 CEP95Q96GE4 821 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 ZNF618Q5T7W0 954 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 C19orf18Q8NEA5 215 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 PALD1Q9ULE6 856 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 PKP3Q9Y446 797 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 TAF4O00268 1085 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 TAF5LO75529 589 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 HIST1H2ADP20671 130 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 KRT20P35900 424 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 LRRC24Q50LG9 513 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 PNKPQ96T60 521 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 HIST1H2AJQ99878 128 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 LZTS2Q9BRK4 669 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 H2AFJQ9BTM1 129 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 ERBB3P21860 1342 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 FAM83GA6ND36 823 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 FAM47DPA6NHR8 397 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 ANGPT2O15123 496 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 AKAP10O43572 662 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 AKAP5P24588 427 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 SIK2Q9H0K1 926 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 IMPAD1Q9NX62 359 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 ZFP69BQ9UJL9 534 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 ABCD1P33897 745 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 SCNN1DP51172 638 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 GTF2IP78347 998 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 TAF13Q15543 124 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 FAM45AQ8TCE6 357 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 IMPACTQ9P2X3 320 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 APPL1Q9UKG1 709 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 SNX6Q9UNH7 406 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 IKBKBO14920 756 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 CLYBLQ8N0X4 340 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 PDIK1LQ8N165 341 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 SENP2Q9HC62 589 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 MAP3K13O43283 966 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 SNX4O95219 450 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 CLCN6P51797 869 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 TFAP4Q01664 338 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 MICU2Q8IYU8 434 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 ZNF24P17028 368 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 FBXO42Q6P3S6 717 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 KRT26Q7Z3Y9 468 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 SPICE1Q8N0Z3 855 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 CALML6Q8TD86 181 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 ACAP3Q96P50 834 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 GUCY1B2O75343 617 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 EPN2O95208 641 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 ARL4CP56559 192 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 ICA1Q05084 483 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 LRRC36Q1X8D7 754 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 CHMP2BQ9UQN3 213 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 F8W810 466 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 CLIC2O15247 247 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 DTNBO60941 627 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 RAPGEF3O95398 923 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 CYBBP04839 570 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 C2orf54Q08AI8 447 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 CPB1P15086 417 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS3-201ENST00000311160 SCRN3Q0VDG4 424 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms