RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 TRADDQ15628 312 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-201ENST00000311008 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-201ENST00000311008 FOXR1Q6PIV2 292 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-201ENST00000311008 MORC4Q8TE76 937 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-201ENST00000311008 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-201ENST00000311008 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-201ENST00000311008 RAB17Q9H0T7 212 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-201ENST00000311008 PLAAQ9Y263 795 aa21.14■□□□□ 0.98
SPNS1-201ENST00000311008 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.14■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 HSPA6P17066 643 aa21.14■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 GCLMP48507 274 aa21.14■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.14■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.14■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 AMACRQ9UHK6 382 aa21.14■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 RTN2O75298 545 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 GZMAP12544 262 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 PEX3P56589 373 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 PTENP60484 403 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 GPC5P78333 572 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 TAS2R14Q9NYV8 317 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 FTLP02792 175 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 ITGA4P13612 1032 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 KCNA3P22001 575 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 USP37Q86T82 979 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 UBL4BQ8N7F7 174 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 RMDN3Q96TC7 470 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.13■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 GRIN2DO15399 1336 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 BACH1O14867 736 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 DPEP1P16444 411 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 HSD17B3P37058 310 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 MFAP3P55082 362 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 XKR9Q5GH70 373 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 PXMP2Q9NR77 195 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 TISP43B9A030 160 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 SLC16A4O15374 487 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 MAFGO15525 162 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 SPP2Q13103 211 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa21.12■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 FAM187AA6NFU0 413 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 TTI1O43156 1089 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 MTA2O94776 668 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 MYZAPP0CAP1 466 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 NR1D1P20393 614 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 ENPEPQ07075 957 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 CEP85LQ5SZL2 805 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 PALB2Q86YC2 1186 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 BCAS4Q8TDM0 211 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 TBX20Q9UMR3 447 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 COG5Q9UP83 839 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 ALG6Q9Y672 507 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 ZEB2O60315 1214 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 BIRC3Q13489 604 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 UGCGQ16739 394 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 DCAF12L1Q5VU92 463 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 KCTD16Q68DU8 428 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 KRT39Q6A163 491 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 KIFAP3Q92845 792 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 TEPSINQ96N21 525 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 EBAG9O00559 213 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 DAPK3O43293 454 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 ERLIN2O94905 339 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 GGPS1O95749 300 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS1-201ENST00000311008 VCAM1P19320 739 aa21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms