RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309576.10

PPARG-202, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene PPARG, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-202ENST00000309576 FSD2A1L4K1 749 aa21.85■■□□□ 1.09
PPARG-202ENST00000309576 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.85■■□□□ 1.09
PPARG-202ENST00000309576 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.85■■□□□ 1.09
PPARG-202ENST00000309576 PIGRP01833 764 aa21.85■■□□□ 1.09
PPARG-202ENST00000309576 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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PPARG-202ENST00000309576 FAM187BQ17R55 369 aa21.85■■□□□ 1.09
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PPARG-202ENST00000309576 RSPH3Q86UC2 560 aa21.85■■□□□ 1.09
PPARG-202ENST00000309576 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PPARG-202ENST00000309576 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.85■■□□□ 1.09
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PPARG-202ENST00000309576 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.84■■□□□ 1.09
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PPARG-202ENST00000309576 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.84■■□□□ 1.09
PPARG-202ENST00000309576 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.84■■□□□ 1.09
PPARG-202ENST00000309576 PRKCBP05771 671 aa21.83■■□□□ 1.09
PPARG-202ENST00000309576 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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PPARG-202ENST00000309576 TOX2Q96NM4 488 aa21.83■■□□□ 1.09
PPARG-202ENST00000309576 FANCLQ9NW38 375 aa21.83■■□□□ 1.09
PPARG-202ENST00000309576 EXOC7Q9UPT5 735 aa21.83■■□□□ 1.09
PPARG-202ENST00000309576 SIP14410 1827 aa21.83■■□□□ 1.09
PPARG-202ENST00000309576 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.83■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 B4GALT5O43286 388 aa21.83■■□□□ 1.08
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PPARG-202ENST00000309576 FAM26DQ5JW98 314 aa21.83■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.83■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 SMTNL1A8MU46 457 aa21.82■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 BECN2A8MW95 431 aa21.82■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
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PPARG-202ENST00000309576 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.82■■□□□ 1.08
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PPARG-202ENST00000309576 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.82■■□□□ 1.08
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PPARG-202ENST00000309576 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.81■■□□□ 1.08
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PPARG-202ENST00000309576 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.8■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.8■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 CAGE1Q8TC20 777 aa21.8■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 M0QZ92 97 aa21.79■■□□□ 1.08
PPARG-202ENST00000309576 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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