RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 CPB2Q96IY4 423 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 H0YCG3 227 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 KINO60870 393 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 AMHP03971 560 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 PRR29P0C7W0 189 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 DEFB103AP81534 67 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 DSC3Q14574 896 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 CHST12Q9NRB3 414 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 RGS18Q9NS28 235 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 MYL1P05976 194 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 STRN3Q13033 797 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 FAM187BQ17R55 369 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 UNC13DQ70J99 1090 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 TIGD1Q96MW7 591 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 FIZ1Q96SL8 496 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 DACT1Q9NYF0 836 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 USP20Q9Y2K6 914 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD4-201ENST00000306324 ACKR2O00590 384 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 AXLP30530 894 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 UPP2O95045 317 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 EDN1P05305 212 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 POSTNQ15063 836 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 NOTUMQ6P988 496 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 HPS3Q969F9 1004 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 SLC9A7Q96T83 725 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PPC1 479 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 GCNT3O95395 438 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 PNOCQ13519 176 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 FAM117BQ6P1L5 589 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 C9IYK1 514 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 KLRC4O43908 158 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 SCP2P22307 547 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 DPYDQ12882 1025 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 EXOC1Q9NV70 894 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 TBX20Q9UMR3 447 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1B0GUA9 196 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 RPN1P04843 607 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 ABCD1P33897 745 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 CASP5P51878 434 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 GTF2BQ00403 316 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 BICD1Q96G01 975 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 LRFN2Q9ULH4 789 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 GRXCR1A8MXD5 290 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 MYBP10242 640 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 RNF169Q8NCN4 708 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 TOP1MTQ969P6 601 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC51Q96ER9 411 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 ZBED2Q9BTP6 218 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 FAM105AQ9NUU6 356 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 A0A0U1RQF3 1178 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 N4BP3O15049 544 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 EHHADHQ08426 723 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 UBXN11Q5T124 520 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 ECHDC2Q86YB7 292 aa24.52■■□□□ 1.52
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