RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 HIPK4Q8NE63 616 aa15.77■□□□□ 0.12
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CCNDBP1-201ENST00000300213 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM187AA6NFU0 413 aa15.77■□□□□ 0.11
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CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF207Q6ZRF8 634 aa15.75■□□□□ 0.11
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CCNDBP1-201ENST00000300213 LMNB1P20700 586 aa15.74■□□□□ 0.11
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CCNDBP1-201ENST00000300213 JDP2Q8WYK2 163 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 HES6Q96HZ4 224 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 USTQ9Y2C2 406 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa15.74■□□□□ 0.11
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP17L5A8MUK1 530 aa15.74■□□□□ 0.11
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TMED1Q13445 227 aa15.74■□□□□ 0.11
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