RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.77■■□□□ 1.08
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HPS6-201ENST00000299238 TBC1D12O60347 775 aa21.77■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 SLITRK3O94933 977 aa21.77■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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HPS6-201ENST00000299238 FAM160B2Q86V87 743 aa21.77■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 KSR1Q8IVT5 923 aa21.77■■□□□ 1.08
HPS6-201ENST00000299238 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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HPS6-201ENST00000299238 GAS7O60861 476 aa21.76■■□□□ 1.07
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HPS6-201ENST00000299238 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa21.76■■□□□ 1.07
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HPS6-201ENST00000299238 TRIM73Q86UV7 250 aa21.75■■□□□ 1.07
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HPS6-201ENST00000299238 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
HPS6-201ENST00000299238 RAPGEF5Q92565 580 aa21.72■■□□□ 1.07
HPS6-201ENST00000299238 PARVGQ9HBI0 331 aa21.72■■□□□ 1.07
HPS6-201ENST00000299238 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HPS6-201ENST00000299238 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.072e-8■■■■■ 37.8
HPS6-201ENST00000299238 CEP104O60308 925 aa21.72■■□□□ 1.07
HPS6-201ENST00000299238 ASNSP08243 561 aa21.72■■□□□ 1.07
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