RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 FZD8Q9H461 694 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC39Q9UFE4 941 aa27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 C5orf67F2Z3F1 127 aa27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 H3BNC9 293 aa27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 PPP6R2O75170 966 aa27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 LIG1P18858 919 aa27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 TXLNAP40222 546 aa27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 EFNA5P52803 228 aa27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 MAPK7Q13164 816 aa27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 PGBD4Q96DM1 585 aa27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 PRIMPOLQ96LW4 560 aa27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 C17orf75Q9HAS0 396 aa27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 HCSTQ9UBK5 93 aa27.58■■■□□ 2.01
CXCL2-201ENST00000296031 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa27.57■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC169A6NNP5 214 aa27.57■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 BRD1O95696 1058 aa27.57■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 PEX3P56589 373 aa27.57■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 MAPK6Q16659 721 aa27.57■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 FAM187BQ17R55 369 aa27.57■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 ATL3Q6DD88 541 aa27.57■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 RAD54LQ92698 747 aa27.57■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 PLVAPQ9BX97 442 aa27.57■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 LMCD1Q9NZU5 365 aa27.57■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 REV3LO60673 3130 aa27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1B0GUA9 196 aa27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 MEIS3P2A8K0S8 358 aa27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 SFI1A8K8P3 1242 aa27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 PRKCBP05771 671 aa27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 DDIT3P35638 169 aa27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 NPTX2P47972 431 aa27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 MCM6Q14566 821 aa27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 ARSHQ5FYA8 562 aa27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 GPBP1Q86WP2 473 aa27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 LRRC43Q8N309 656 aa27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC113Q9H0I3 377 aa27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 ZDHHC9Q9Y397 364 aa27.56■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa27.55■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM132AQ24JP5 1023 aa27.55■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 CNNM3Q8NE01 707 aa27.55■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 RSPH1Q8WYR4 309 aa27.55■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 CWH43Q9H720 699 aa27.55■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 CFAP45Q9UL16 551 aa27.55■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 ACKR2O00590 384 aa27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 RRAGBQ5VZM2 374 aa27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 SLC27A1Q6PCB7 646 aa27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 GLB1LQ6UWU2 654 aa27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 LRRC55Q6ZSA7 311 aa27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 KMT5AQ9NQR1 393 aa27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 AAASQ9NRG9 546 aa27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 STK17AQ9UEE5 414 aa27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 KCNG1Q9UIX4 513 aa27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa27.54■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 K7ERI5 159 aa27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 NPTXRO95502 500 aa27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 PLS3P13797 630 aa27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 NCLP19338 710 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 PTPROQ16827 1216 aa27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 NAALADL2Q58DX5 795 aa27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 AGMOQ6ZNB7 445 aa27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 KCNG4Q8TDN1 519 aa27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 P2RX5Q93086 422 aa27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 USP20Q9Y2K6 914 aa27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 IPPQ9Y573 584 aa27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa27.53■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 TTLL13PA6NNM8 815 aa27.52■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 OFD1O75665 1012 aa27.52■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 ITGA4P13612 1032 aa27.52■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 LAG3P18627 525 aa27.52■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.52■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 KLHL23Q8NBE8 558 aa27.52■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa27.52■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 SPIRE2Q8WWL2 714 aa27.52■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 REEP2Q9BRK0 252 aa27.52■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 RSAD1Q9HA92 442 aa27.52■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa27.52■■■□□ 2
CXCL2-201ENST00000296031 ODF2LQ9ULJ1 636 aa27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms