RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 VCAM1P19320 739 aa30.24■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 PADI6Q6TGC4 694 aa30.24■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 PALB2Q86YC2 1186 aa30.24■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 UBL4BQ8N7F7 174 aa30.24■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 BANK1Q8NDB2 785 aa30.24■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 MXRA8Q9BRK3 442 aa30.24■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 EMSYQ7Z589 1322 aa30.24■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 GMNCA6NCL1 334 aa30.24■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 LRRN2O75325 713 aa30.24■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 VAMP7P51809 220 aa30.24■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 TRAPPC3O43617 180 aa30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 RAD17O75943 681 aa30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 KRT71Q3SY84 523 aa30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 ALG6Q9Y672 507 aa30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 MAPK13O15264 365 aa30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 GBP1P32455 592 aa30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 RDH13Q8NBN7 331 aa30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 ALG3Q92685 438 aa30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 ACCSQ96QU6 501 aa30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 VCPKMTQ9H867 229 aa30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 EPC2Q52LR7 807 aa30.22■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 HOOK3Q86VS8 718 aa30.22■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 MORC4Q8TE76 937 aa30.22■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 CYFIP2Q96F07 1278 aa30.22■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 RPS6KC1Q96S38 1066 aa30.22■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa30.22■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 GGPS1O95749 300 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 FTLP02792 175 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 CDR1P51861 262 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 GPC5P78333 572 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 IFFO1Q0D2I5 559 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 ICE2Q659A1 982 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 SLC20A1Q8WUM9 679 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 ERVK-5Q9HDB9 667 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 USP20Q9Y2K6 914 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 PMM2O15305 246 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 PHF2O75151 1096 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 P4HBP07237 508 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 NUDT17P0C025 328 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 CHRNA3P32297 505 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 ARMC9Q7Z3E5 817 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 MIER3Q7Z3K6 550 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 JAMLQ86YT9 394 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 KAT2BQ92831 832 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 TRIM31Q9BZY9 425 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 FEM1BQ9UK73 627 aa30.21■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 RTN2O75298 545 aa30.2■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 MTA2O94776 668 aa30.2■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 DLG4P78352 724 aa30.2■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 TNIP1Q15025 636 aa30.2■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 NIPA1Q7RTP0 329 aa30.2■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 LDHDQ86WU2 507 aa30.2■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 CNPY4Q8N129 248 aa30.2■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 TLCD1Q96CP7 247 aa30.2■■■□□ 2.43
UBP1-201ENST00000283628 VGLL3A8MV65 326 aa30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 HSD17B4P51659 736 aa30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 DRP2Q13474 957 aa30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 C6orf89Q6UWU4 347 aa30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF19Q8IW93 802 aa30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 ZSWIM1Q9BR11 485 aa30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PPP3CAQ08209 521 aa30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 DLGAP5Q15398 846 aa30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 XXYLT1Q8NBI6 393 aa30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 FAM151AQ8WW52 585 aa30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 TCP10L2B9ZVM9 353 aa30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PLS3P13797 630 aa30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 FNTAP49354 379 aa30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 TMOD4Q9NZQ9 345 aa30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PCYOX1Q9UHG3 505 aa30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PODXLO00592 558 aa30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 GZMAP12544 262 aa30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 ITGB5P18084 799 aa30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PCIF1Q9H4Z3 704 aa30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PARP2Q9UGN5 583 aa30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 ZNRF3Q9ULT6 936 aa30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 CAPN7Q9Y6W3 813 aa30.18■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 RPTORQ8N122 1335 aa30.17■■■□□ 2.42
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