RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283206.8

TMEM87B-201, Transcript of transmembrane protein 87B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TMEM87B, Length 5,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87B-201ENST00000283206 TTC17Q96AE7 1141 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 UNC13BO14795 1591 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 A8MXQ7 604 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 CHRNA3P32297 505 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 TMPRSS15P98073 1019 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 NR1H3Q13133 447 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 RFFLQ8WZ73 363 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.88□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 TAC1P20366 129 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 BCAR1P56945 870 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 RNF149Q8NC42 400 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.033e-6■□□□□ 10.1
TMEM87B-201ENST00000283206 PPME1Q9Y570 386 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 DGAT1O75907 488 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 HSPA4LO95757 839 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 MICALL2Q8IY33 904 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 URGCPQ8TCY9 931 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 TIPINQ9BVW5 301 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 CAPN11Q9UMQ6 739 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 MAPK13O15264 365 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 XKR3Q5GH77 459 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 PDXDC1Q6P996 788 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 CREB3O43889 395 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 KIF12Q96FN5 646 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 ACAP3Q96P50 834 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 FAM205CA6NFA0 338 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 NCK2O43639 380 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 MMEP08473 750 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 GYS2P54840 703 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 HOXD10P28358 340 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 KYAT1Q16773 422 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 KLHL38Q2WGJ6 581 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 EXT2Q93063 718 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 ZNF560Q96MR9 790 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 PTPRUQ92729 1446 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 TBX3O15119 743 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 GSTA4O15217 222 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 CFLARO15519 480 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 SMIM24O75264 130 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 SERPINI1Q99574 410 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 A0A0G2JLW4 131 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 EFHC2Q5JST6 749 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 KIF2CQ99661 725 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 C19orf81C9J6K1 198 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 GANCQ8TET4 914 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 CHGBP05060 677 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 PDCLQ13371 301 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 BFARQ9NZS9 450 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 FAM187AA6NFU0 413 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 NTSR2O95665 410 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 ADORA2BP29275 332 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM87B-201ENST00000283206 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms