RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 FAM187AA6NFU0 413 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRE-201ENST00000254667 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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PTPRE-201ENST00000254667 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 RASA1P20936 1047 aa20.2■□□□□ 0.82
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PTPRE-201ENST00000254667 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.19■□□□□ 0.82
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PTPRE-201ENST00000254667 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
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PTPRE-201ENST00000254667 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 CPS1P31327 1500 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 TTC36A6NLP5 189 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTPRE-201ENST00000254667 SLC25A27O95847 323 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTPRE-201ENST00000254667 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 H3BRJ5 948 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 FOXN1O15353 648 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 MAGEB2O15479 319 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 RFC5P40937 340 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRE-201ENST00000254667 CHMP6Q96FZ7 201 aa20.17■□□□□ 0.82
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