RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243103.3

HOXC12-201, Transcript of homeobox C12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC12, Length 3,335 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12-201ENST00000243103 SMYD3Q9H7B4 428 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 RASA4BC9J798 803 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 ASAP2O43150 1006 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 RASA4O43374 803 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 TDP2O95551 362 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 GNA14O95837 355 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 NPY5RQ15761 445 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 MPP4Q96JB8 637 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 CLPTM1LQ96KA5 538 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 NUDT12Q9BQG2 462 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 DOLKQ9UPQ8 538 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 C5P01031 1676 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 TRPA1O75762 1119 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 DLATP10515 647 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 SLMAPQ14BN4 828 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 SEPT2Q15019 361 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 TMTC3Q6ZXV5 915 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 CYP4X1Q8N118 509 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 GGA2Q9UJY4 613 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXC12-201ENST00000243103 CDR2Q01850 454 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 MIPOL1Q8TD10 442 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 P3H4Q92791 437 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 USP40Q9NVE5 1235 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 LRRC37A3O60309 1634 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 GYG2O15488 501 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 CHMP2AO43633 222 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 RHOBTB3O94955 611 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 KITP10721 976 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 USP11P51784 963 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 C2CD6Q53TS8 623 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 C6orf118Q5T5N4 469 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 TTBK2Q6IQ55 1244 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 IZUMO2Q6UXV1 221 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 DDX12PQ92771 950 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 ERP44Q9BS26 406 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 PACSIN3Q9UKS6 424 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 GOLGA8MH3BSY2 632 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 SORBS3O60504 671 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 GSTA1P08263 222 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 FGFR2P21802 821 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 INHBCP55103 352 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 MPP3Q13368 585 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 FAM210AQ96ND0 272 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 MAP3K7O43318 606 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 SPOPO43791 374 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 STAMBPO95630 424 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 AFPP02771 609 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 LDHBP07195 334 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 DESP17661 470 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 CA4P22748 312 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 PIK3CAP42336 1068 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 MMP13P45452 471 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 GNAQP50148 359 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 GALCP54803 685 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 KDSRQ06136 332 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 RIPK1Q13546 671 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 MYBPC3Q14896 1274 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 SEC23AQ15436 765 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 MTHFD1LQ6UB35 978 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF662Q6ZS27 426 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 TBCKQ8TEA7 893 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 KRT35Q92764 455 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 ZFP69BQ9UJL9 534 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 LZTS1Q9Y250 596 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 AK5Q9Y6K8 562 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 SLIT1O75093 1534 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 USP17L5A8MUK1 530 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 UNC5CO95185 931 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 STAT3P40763 770 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 MAP7D3Q8IWC1 876 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 TXLNGQ9NUQ3 528 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 ARHGAP42A6NI28 874 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 KCNH2Q12809 1159 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 ACP6Q9NPH0 428 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC12-201ENST00000243103 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms