RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 KRT85P78386 507 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 ADGRE1Q14246 886 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 CLLU1OSQ5K130 101 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 FIBCD1Q8N539 461 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 PDILTQ8N807 584 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 DEPTORQ8TB45 409 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 MYLIPQ8WY64 445 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 MYMKA6NI61 221 aa24.6■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 ACKR2O00590 384 aa24.6■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 RESP18Q5W5W9 173 aa24.6■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 ARNTL2Q8WYA1 636 aa24.6■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 LPPQ93052 612 aa24.6■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.6■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 EYSQ5T1H1 3165 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 CCDC169A6NNP5 214 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 LPXNO60711 386 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 PRKCBP05771 671 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 EFNA5P52803 228 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 NOTUMQ6P988 496 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC19Q96DA6 116 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 SPATA32Q96LK8 384 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 FIZ1Q96SL8 496 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 HCSTQ9UBK5 93 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.58■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 NLRC5Q86WI3 1866 aa24.58■■□□□ 1.53
SYF2-201ENST00000236273 TBKBP1A7MCY6 615 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A4O15374 487 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 SLC34A2O95436 690 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 RAB27AP51159 221 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 MAPK6Q16659 721 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 LONRF3Q496Y0 759 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 EPC2Q52LR7 807 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 AGMOQ6ZNB7 445 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 TMEM192Q8IY95 271 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 KCNN1Q92952 543 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 CCDC51Q96ER9 411 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 TMEM117Q9H0C3 514 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 RNF39Q9H2S5 420 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1671Q9BY89 1806 aa24.57■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 SKIP12755 728 aa24.57■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 STAT6P42226 847 aa24.57■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 ADALQ6DHV7 355 aa24.57■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 SV2BQ7L1I2 683 aa24.57■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 RNF169Q8NCN4 708 aa24.57■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.57■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 CWH43Q9H720 699 aa24.57■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa24.56■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 K7ERI5 159 aa24.56■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 OFD1O75665 1012 aa24.56■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 BMPR1AP36894 532 aa24.56■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 NCKAP1LP55160 1127 aa24.56■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 HELQQ8TDG4 1101 aa24.56■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 DDX12PQ92771 950 aa24.56■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.56■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.56■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 IPPQ9Y573 584 aa24.56■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 C5orf67F2Z3F1 127 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 HOXA2O43364 376 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 LIG1P18858 919 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 DYMQ7RTS9 669 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 SAMD11Q96NU1 681 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 HES2Q9Y543 173 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 REV3LO60673 3130 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms