RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 IFT74Q96LB3 600 aa20.26■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.26■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.26■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.26■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 MOCS3O95396 460 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 MARK3P27448 753 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 TUBB4BP68371 445 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 SLC18A3Q16572 532 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 LMO3Q8TAP4 145 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 PNMA3Q9UL41 463 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 GFPT2O94808 682 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 GLRA2P23416 452 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 CHMP4BP1P59074 171 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 MYH10P35580 1976 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 TBC1D8O95759 1140 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 DRP2Q13474 957 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 GPR20Q99678 358 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 GPR88Q9GZN0 384 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 RRAGCQ9HB90 399 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 F8VZ95 297 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 SRGAP2O75044 1071 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 BICD1Q96G01 975 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 MYO6Q9UM54 1294 aa20.24■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 PJA2O43164 708 aa20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 CETPP11597 493 aa20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 ARL2P36404 184 aa20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 BRD3Q15059 726 aa20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 GLG1Q92896 1179 aa20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 BUB1O43683 1085 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 FAM84AQ96KN4 292 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 PLXNB2O15031 1838 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC151A5D8V7 595 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 MAPK13O15264 365 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 EVI5O60447 810 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 PRKCIP41743 596 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 GTF2A2P52657 109 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 EPC2Q52LR7 807 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 ARMCX2Q7L311 632 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 SPATA33Q96N06 139 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 STK33Q9BYT3 514 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 AZI2Q9H6S1 392 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.22■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 SOX5P35711 763 aa20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 STAT1P42224 750 aa20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 MORC4Q8TE76 937 aa20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 SASH3O75995 380 aa20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 EDN1P05305 212 aa20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 ADORA2AP29274 412 aa20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 MXI1P50539 228 aa20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 FBXL18Q96ME1 805 aa20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 FAM170AA1A519 330 aa20.2■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 KLRC1P26715 233 aa20.2■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.2■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SIKE1-201ENST00000060969 DEPTORQ8TB45 409 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms