RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 IL25Q9H293 177 aa9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 SAMM50Q9Y512 469 aa9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 WDR64B1ANS9 1081 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 INPPL1O15357 1258 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 LAMTOR5O43504 91 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 GALTP07902 379 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 LIFRP42702 1097 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 NUCB1Q02818 461 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 MICU3Q86XE3 530 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 SLC44A3Q8N4M1 653 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 DCLK2Q8N568 766 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 PHKBQ93100 1093 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 PGBD4Q96DM1 585 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM175Q9BSA9 504 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 RTKNQ9BST9 563 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 ARID2Q68CP9 1835 aa9.75□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 SOD2P04179 222 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 RXRAP19793 462 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 ATP4AP20648 1035 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 SLC11A1P49279 550 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 DNM2P50570 870 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 AK2P54819 239 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 PRKCEQ02156 737 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 CREMQ03060 361 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 HTR4Q13639 388 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF410Q86VK4 478 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 HDAC7Q8WUI4 952 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 FOXQ1Q9C009 403 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 PIDD1Q9HB75 910 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 GMEB2Q9UKD1 530 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.74□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 FAM86B1E9PN63 330 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 C2CD2LO14523 706 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 C1RP00736 705 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 ADRB1P08588 477 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 FGFR4P22455 802 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 GLUD2P49448 558 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
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HLA-B-257ENST00000640094 MTSS1LQ765P7 747 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 FANCBQ8NB91 859 aa9.73□□□□□ -0.85
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HLA-B-257ENST00000640094 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 MYADMQ96S97 322 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 EPC1Q9H2F5 836 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 RSAD1Q9HA92 442 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 USP18Q9UMW8 372 aa9.73□□□□□ -0.85
HLA-B-257ENST00000640094 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.73□□□□□ -0.85
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