RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636904.1

U6.97-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.97-201ENST00000636904 FZD8Q9H461 694 aa-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 KRT84Q9NSB2 600 aa-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 FAM13BQ9NYF5 915 aa-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 PAK5Q9P286 719 aa-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 ASH2LQ9UBL3 628 aa-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 CHIC2Q9UKJ5 165 aa-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 TCFL5Q9UL49 500 aa-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 NEU3Q9UQ49 428 aa-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 ZNF175Q9Y473 711 aa-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 PCNX2A6NKB5 2137 aa-0.83□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 EVPLQ92817 2033 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 SMTNL1A8MU46 457 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 BTBD18B2RXH4 712 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 SPTLC2O15270 562 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 TULP3O75386 442 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 TCEA3O75764 348 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 CST3P01034 146 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 HLA-DOAP06340 250 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 CFC1BP0CG36 223 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 CFC1P0CG37 223 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 PSG1P11464 419 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 PRF1P14222 555 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 NPR3P17342 541 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 SSFA2P28290 1259 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 MPGP29372 298 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 PSG6Q00889 435 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 MAP7D1Q3KQU3 841 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 SHC4Q6S5L8 630 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 GPR155Q7Z3F1 870 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 STK32CQ86UX6 486 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 FAM126BQ8IXS8 530 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 GALNT16Q8N428 558 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 RFLNBQ8N5W9 214 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 CPT1CQ8TCG5 803 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 ACTRT2Q8TDY3 377 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 SSH3Q8TE77 659 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 ZFYVE19Q96K21 471 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 JMJD8Q96S16 334 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 IL25Q9H293 177 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 CPNE5Q9HCH3 593 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 POLR3EQ9NVU0 708 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 ERVK13-1Q9NX77 482 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 CROTQ9UKG9 612 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 CSAG2Q9Y5P2 127 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 COL1A2P08123 1366 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 USH2AO75445 5202 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 CACNA1EQ15878 2313 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.84□□□□□ -2.54
U6.97-201ENST00000636904 FLNCQ14315 2725 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 LRP2P98164 4655 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 LRCOL1A6NCL2 159 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 C2orf71A6NGG8 1288 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 UBAP1LF5GYI3 381 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 FCHO1O14526 889 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 SLC16A5O15375 505 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 SLC26A4O43511 780 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 MFAP3LO75121 409 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 BCAR3O75815 825 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 IPO13O94829 963 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 KNG1P01042 644 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 FGAP02671 866 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 THBDP07204 575 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 PCSK6P29122 969 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 CCR10P46092 362 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ART1P52961 327 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 MXRA7P84157 204 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 CTDSPL2Q05D32 466 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 BEAN1Q3B7T3 259 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 BBS9Q3SYG4 887 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 IQCCQ4KMZ1 466 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 SLC25A30Q5SVS4 291 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 VASNQ6EMK4 673 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 MFSD5Q6N075 450 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 PI16Q6UXB8 463 aa-0.85□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ZNF66Q6ZN08 573 aa-0.85□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms